Preview

Инфекция и иммунитет

Расширенный поиск

Генетическое разнообразие вируса гепатита С среди населения Нанайского района Хабаровского края

https://doi.org/10.15789/2220-7619-GDO-1265

Полный текст:

Аннотация

Изучение генетического разнообразия вируса гепатита С (HCV) имеет большое практическое значение при проведении молекулярно-эпидемиологических исследований, разработке средств специфической профилактики и для определения тактики терапии.

Цель исследования — провести анализ генетического разнообразия HCV, циркулирующего среди населения Нанайского района Хабаровского края.

Материалы и методы. Проведен молекулярно-генетический анализ 124 образцов плазмы крови от пациентов с диагнозом хронический гепатит C (ХГС), проживающих на территории Нанайского района Хабаровского края.

Результаты. РНК HCV была обнаружена в 84 (67,7±4,2%) образцах плазмы крови. Генотипирование HCV, проведенное с использованием набора «АмплиСенс-1/2/3» (ФБУН Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва) показало, что на территории района наиболее распространен 3 генотип вируса — 47,6±5,4% (n = 40). Генотип 1 HCV обнаружен у 30 пациентов (35,7±5,2%). В 13 случаях (15,5±3,9%) выявлен 2 генотип и у 1 пациента (1,2±1,2%) генотип не определился. Филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей области NS5b генома HCV, проведенный для 60 РНК HCV-положительных образцов, показал следующее соотношение субтипов: 1а — 2 (3,3±2,3%), 1в — 23 (38,3±6,3%), 2а — 6 (10±3,9%), 2с — 2 (3,3±2,3%), 3а — 27(45±6,4%). В ходе исследования было выявлено 3 пробы, принадлежащие к рекомбинантной форме вируса RF2k/1b. С целью подтверждения рекомбинации были получены полные нуклеотидные последовательности гена NS2. Результаты исследования свидетельствуют о необходимости проведения дополнительного комплексного обследования больных хроническими формами гепатита С с применением современных молекулярно-биологических методов для принятия решений об адекватной терапии, учитывая особенности выделенных изолятов. Данные о молекулярно-генетических характеристиках HCV, циркулирующих на отдельных территориях Дальнего Востока, весьма ограничены, и проведенное молекулярно-генетическое исследование дополнит в существующие представления о циркуляции геновариантов HCV на территориях Российской Федерации.

Об авторах

В. О. Котова
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора
Россия

Котова В.О., Котова Валерия Олеговна - старший научный сотрудник, заведующий лабораторией эпидемиологии и профилактики вирусных гепатитов и СПИДа.

680000, Хабаровск, ул. Шевченко, 2, Тел.: 8 (4212) 46-18-54



Л. А. Балахонцева
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора
Россия

Руководитель Дальневосточного окружного центра по профилактике и борьбе со СПИДом.

Хабаровск



Е. А. Базыкина
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора
Россия

Младший научный сотрудник лаборатории эпидемиологии и профилактики вирусных гепатитов и СПИДа.

Хабаровск



О. Е. Троценко
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора
Россия

Доктор медицинских наук, директор Хабаровского НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора.

Хабаровск



В. Н. Бельды
КГБУЗ Троицкая центральная районная больница МЗ Хабаровского края
Россия

Врач-инфекционист.

С. Троицкое, Нанайский район, Хабаровский край



С. Е. Кирдяшова
КГБУЗ Троицкая центральная районная больница МЗ Хабаровского края
Россия

Главный врач

С. Троицкое, Нанайский район, Хабаровский край



Список литературы

1. Дементьева Н.Е., Калинина О.В., Знойко О.О., Беляков Н.А., Жебрун А.Б. Циркулирующая рекомбинантная форма вируса гепатита С RF2k/1b: проблемы диагностики и терапии // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2016. Т. 8, № 1. С. 42—52. doi: 10.22328/2077-9828-2016-8-1-42-52

2. Кравченко А.В., Куимова У.А., Ганкина Н.Ю., Канестри В.Г., Чуланов В.П. Предикторы устойчивого вирусологического ответа при терапии хронического гепатита пегилированным интерфероном и рибавирином у больных ВИЧ-инфекцией // Инфекционные болезни. 2014. Т. 12, № 2. С. 30—34.

3. Кюрегян К.К., Михайлов М.И. Молекулярно-биологические основы контроля вирусных гепатитов. М.: Икар, 2013. 336 с.

4. Львов Д.К., Самохвалов Е.И., Миширо С., Тсуда Ф., Селиванов Н.А., Окамото Х., Стаханова В.М. Закономерности распространения вируса гепатита С и его генотипов в России и странах СНГ // Вопросы вирусологии. 1997. № 4. С. 157—161.

5. Мукомолов С.Л., Левакова Л.Г., Сулягина Е.В., Синайская Е.В., Болсун Д.Д., Иванова Н.В. Современная эпидемиология гепатита С в России // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2012. № 6. C. 21—25.

6. Семенов А.В., Останкова Ю.В., Герасимова В.В., Бичурина М.А., Козлов А.В., Мукомолов С.Л., Тотолян А.А. Молекулярно-эпидемиологические особенности изолятов вируса гепатита С из разных регионов Республики Саха (Якутия) // Инфекция и иммунитет. 2015. Т. 5, № 4. С. 359—372. doi: 10.15789/2220-7619-2015-4-359-372

7. Соболева Н.В., Карлсен А.А., Кожанова Т.В., Кичатова В.С., Клушкина В.В., Исаева О.В., Игнатьева М.Е., Романенко В.В., Ооржак Н.Д., Малинникова Е.Ю., Кюрегян К.К., Михайлов М.И. Распространенность вируса гепатита С среди условно здорового населения Российской Федерации // Журнал инфектологии. 2017. Т. 9, № 2. С. 56—64.

8. Чуб Е.В., Кочнева Г.В., Гранитов В.М., Нетесов С.В. Рекомбинанты вируса гепатита С типа 2k/1bY населения Алтайского края // Инфекционные болезни. 2007. Т. 5, № 4. С. 5—11. [Chub E.V., Kochneva G.V., Granitov V.M., Netesov S.V. Recombinants of hepatitis С virus type 2k/1b in the population of the Altai region. Infektsionnye bolezni = Infectious Diseases, 2007, vol. 5, no. 4, pp. 5-11. (In Russ.)]

9. Чуланов В.П., Пименов Н.Н., Мамонова Н.А., Сагалова О.И., Шестакова И.В., Покровский В.И. Хронический гепатит С как проблема здравоохранения России сегодня и завтра // Терапевтический архив. 2015. № 11. С. 5—10.

10. Borgia S.M., Hedskog C., Parhy B., Hyland R.H., Stamm L.M., Brainard D.M., Subramanian M.G., McHutchison J.G., Mo H., Svarovskaia E., Shafran S.D. Identification of a novel hepatitis C virus genotype from Punjab, India: expanding classification of hepatitis C virus into 8 genotypes. J. Infect. Dis., 2018, vol. 218, no. 11, pp. 1722-1729. doi: 10.1093/infdis/jiy401

11. Bukh J. The history of hepatitis C virus (HCV): Basic research reveals unique features in phylogeny, evolution and the viral life cycle with new perspectives for epidemic control. J. Hepatol., 2016, vol. 65, no. 1, pp. S2-S21. doi: 10.1016/j.jhep.2016.07.035

12. Demetriou V.L., Kyriakou E., Kostrikis L.G. Near-full genome characterisation of two natural intergenotypic 2k/1b recombinant hepatitis C virus isolates. Adv. Virol., 2011: 710438, 7p. doi: 10.1155/2011/710438

13. International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), 2019. URL: https://talk.ictvonline.org (30.05.2019)

14. Kalinina O., Norder H., Mukomolov S., Magnius L.O. A natural intergenotypic recombinant of hepatitis C virus identified in St. Petersburg. J. Virol., 2002, vol. 76, no. 8, pp. 4034-4043. doi: 10.1128/jvi.76.8.4034-4043.2002

15. Kalinina O., Norder H., Magnius L.O. Full-length open reading frame of a recombinant hepatitis C virus strain from St. Petersburg: proposed mechanism for its formation. J. Gen. Virol., 2004, vol. 85, no. 7,pp. 1853—1857. doi: 10.1099/vir.0.79984-0

16. Kuiken C., Simmonds P. Nomenclature and numbering of the hepatitis C virus. Methods Mol. Biol., 2009, no. 510, pp. 33—53. doi: 10.1007/978-1-59745-394-3_4

17. Messina J., Humphreys I., Flaxman A., Brown A., Cooke G.S., Pybus O.G., Barnes E. Global distribution and prevalence of hepatitis C virus genotypes. Hepatology, 2015, vol. 61, no. 1, pp. 77—87. doi: 10.1002/hep.27259

18. Morel V., Descamps V., Francois C., Fournier C., Brochot E., Capron D., Duverlie G., Castelain S. Emergence of a genomic variant of the recombinant 2k/1b strain during a mixed hepatitis C infection: a case report. J. Clin. Virol., 2010, vol. 47, no. 4, pp. 382-386. doi: 10.1016/j.jcv.2010.01.011

19. Rajhi M., Ghedira K., Chouikha A., Djebbi A., Cheikh I., Ben Yahia A., Sadraoui A., Hammami W., Azouz M., Ben Mami N., Triki H. Phylogenetic analysis and epidemic history of hepatitis C virus genotype 2 in Tunisia, North Africa. PLoS One, 2016, vol. 11, no. 4: e0153761. doi: 10.1371/journal.pone.0153761

20. Simmonds P. Genetic diversity and evolution of hepatitis C virus-15 years on. J. Gen. Virol., 2004, vol. 85, no. 11, pp. 3173-3188. doi: 10.1099/vir.0.80401-0

21. Simmonds P., Bukh J., Combet C., Deleage G., Enomoto N., Feinstone S., Halfon P., Inchauspe G., Kuiken C., Maertens G., Mizokami M., Murphy D.G., Okamoto H., Pawlotsky J.M., Penin F., Sablon E., Shin-I T., Stuyver L.J., Thiel H.J., Viazov S., Weiner A.J., Widell A. Consensus proposals for a unified system of nomenclature of hepatitis C virus genotypes. Hepatology, 2005, vol. 42, no. 4, pp. 962-973. doi: 10.1002/hep.20819

22. Smith D.B., Bukh J., Kuiken C., Muerhoff A.S., Rice C.M., Stapleton J.T., Simmonds P. Expanded classification of hepatitis C virus into 7 genotypes and 67 subtypes: updated criteria and genotype assignment web resource. Hepatology, 2014, vol. 59, no. 1, pp. 318-327. doi: 10.1002/hep.26744

23. Tamura K., Stecher G., Peterson D., Filipski A., Kumar S. MEGA6: molecular evolutionary genetics analysis version 6.0. Mol. Biol. Evol., 2013, vol. 30, no. 12, pp. 2725-2729. doi: 10.1093/molbev/mst197

24. Thong V.D., Akkarathamrongsin S., Poovorawan K. Hepatitis C virus genotype 6: virology, epidemiology, genetic variation and clinical implication. World J. Gastroenterol., 2014, vol. 20, no. 11, pp. 2927-2940. doi: 10.3748/wjg.v20.i11.2927

25. WHO. Global hepatitis report, 2017. Geneva: WHO, 2017. 83 p. URL: https://www.who.int/hepatitis/publications/global-hepatitis-report2017/en (15.05.2019)


Дополнительные файлы

Для цитирования:


Котова В.О., Балахонцева Л.А., Базыкина Е.А., Троценко О.Е., Бельды В.Н., Кирдяшова С.Е. Генетическое разнообразие вируса гепатита С среди населения Нанайского района Хабаровского края. Инфекция и иммунитет. 2021;11(1):148-156. https://doi.org/10.15789/2220-7619-GDO-1265

For citation:


Kotova V.O., Balakhontseva L.A., Bazykina E.A., Trotsenko O.E., Beldy V.N., Kirdyashova S.E. Genetic diversity of hepatitis C virus in Nanaian region, Khabarovsk territory. Russian Journal of Infection and Immunity. 2021;11(1):148-156. (In Russ.) https://doi.org/10.15789/2220-7619-GDO-1265

Просмотров: 320


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2220-7619 (Print)
ISSN 2313-7398 (Online)