Preview

Инфекция и иммунитет

Расширенный поиск

ХАРАКТЕРИСТИКА ТОКСИГЕННЫХ ШТАММОВ Corynebacterium diphtheriae, ВЫДЕЛЕННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ РОССИИ

https://doi.org/10.15789/2220-7619-COT-1272

Полный текст:

Аннотация

Резюме. Цель исследования – характеристика токсигенных штаммов Corynebacterium diphtheriaе, выделенных на территории России в 2017 - 2019 гг. В исследование включено 12 токсигенных штаммов C.diphtheriae, выделенных в период с января 2017 г. по июнь 2019 г. Изучение штаммов С.diphtheriae проводили по культурально-морфологическим, токсигенным и биохимическим свойствам. Генотипирование штаммов C.diphtheriae осуществляли с помощью MЛСТ и секвенирования гена dtxR с последующим проведением биоинформационного анализа. Результаты. Токсигенные штаммы С.diphtheriae были выделены в Новосибирской, Самарской и Челябинской областях, Ханты-Мансийском автономном округе - Югре и Республике Северная Осетия - Алания. Среди изученных штаммов, 5 штаммов были выделены от больных дифтерией (из которых только в одном случае была средне-тяжелая форма клинического течения и в остальных – легкая форма) и 7 штаммов – от бактерионосителей. У больных дифтерией в двух случаях идентифицированы штаммы C.diphtheriae биовара gravis, принадлежащие к сиквенс-типу ST25, в одном случае – штамм биовара gravis ST8 и в двух случаях – штаммы биовара mitis ST67. У бактерионосителей токсигенных C.diphtheriae в двух случаях идентифицированы штаммы биовара gravis сиквенс-типа ST25 и в 4 случаях – штаммы биовара mitis ST67. В одном случае идентифицировать сиквенс-тип не удалось. Все выявленные сиквенс-типы являются широко распространенными в мире и представлены большим количеством изолятов в базе данных PubMLST, а также характеризуются значительным количеством производных сиквенс-типов. При этом они входят в различные клональные комплексы и значительно отличаются друг от друга, что способствует их надежному различению в МЛСТ. Изучение особенностей структуры гена dtxR показало, что все выявленные аллельные варианты гена являются типичными для представителей этих сиквенс-типов, новых аллельных варианты гена dtxR у изученных штаммов не было обнаружено. Показано, что несинонимичная замена C440T с заменой аминокислоты А147V встречается в пределах только одного аллеля, характерного для представителей сиквенс-типов ST8, ST185, ST195 и ST451, что говорит о поздно произошедшей мутации. Полиморфизм C640A с заменой аминокислоты L214I присутствует не только в данном аллеле, но и в более базальных ветвях дерева, что свидетельствует об изолейцине как о предковом состоянии белка.

Об авторах

О. Ю. Борисова
ФБУН Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского Роспотребнадзора; ФГБОУ ВО Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова Минздрава России
Россия

доктор медицинских наук, профессор, руководитель лаборатории диагностики дифтерийной и коклюшной инфекций;

профессор кафедры микробиологии и вирусологии



Н. Т. Гадуа
ФБУН Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского Роспотребнадзора
Россия
кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник лаборатории диагностики дифтерийной и коклюшной инфекций


А. С. Пименова
ФБУН Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского Роспотребнадзора
Россия
кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник лаборатории диагностики дифтерийной и коклюшной инфекций


А. В. Чаплин
ФГБОУ ВО Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова Минздрава России; ФБУН Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского Роспотребнадзора
Россия

кандидат медицинских наук, доцент кафедры микробиологии и вирусологии;

научный сотрудник лаборатории диагностики дифтерийной и коклюшной инфекций



И. А. Чагина
ФБУН Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского Роспотребнадзора
Россия
кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник лаборатории диагностики дифтерийной и коклюшной инфекций


Ю. Н. Урбан
ФБУН Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского Роспотребнадзора
Россия
кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории клинической микробиологии и биотехнологии


Н. М. Максимова
ФБУН Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского Роспотребнадзора
Россия

доктор медицинских наук, главный научный сотрудник лаборатории эпиднадзора за дифтерией и коклюшем

 

 



М. П. Корженкова
ФБУН Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского Роспотребнадзора
Россия
кандидат медицинских наук, ведущий научный сотрудник лаборатории эпиднадзора за дифтерией и коклюшем


С. С. Афанасьев
ФБУН Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского Роспотребнадзора
Россия
доктор медицинских наук, главный научный сотрудник


Л. И. Кафарская
ФГБОУ ВО Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова Минздрава России
Россия
доктор медицинских наук, профессор, заведующий кафедрой микробиологии и вирусологии


М. С. Афанасьев
ФГАОУ ВО Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова Минздрава России
Россия
доктор медицинских наук, профессор кафедры клинической аллергологии и иммунологии


В. В. Крикун
БУ ХМАО-Югры Нижневартовская окружная клиническая детская больница
Россия
заведующая бактериологической лабораторией


О. Ю. Якунина
ФБУЗ Центр гигиены и эпидемиологии в Новосибирской области
Россия
заведующая бактериологической лабораторией


Список литературы

1. Борисова О.Ю., Мазурова И.К., Чагина И.А., Пименова А.С., Донских Е.Е., Алешкин В.А. Мультилокусное секвенирование токсигенных штаммов Corynebacterium diphtheriae, выделенных в России в 2002 - 2012 гг. // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2013. № 4. С. 17 - 23.

2. Корженкова М.П. Клиника дифтерии в период высокой и низкой заболеваемости // Вакцинация. Новости вакцинопрофилактики. 2006. Т. 14, № 3. С. 4 - 6.

3. Корженкова М.П., Малышев Н.А., Максимова Н.М., Маркина С.С., Черкасова В.В., Шестакова О.М., Базарова М.В. Уроки дифтерии // БИОпрепараты. Профилактика, диагностика, лечение. 2011. Т. 42, № 2. С. 30 - 35.

4. Максимова Н.М., Якимова Т.Н., Маркина С.С., Яцковский К.А., Адугюзелов С.Э. Дифтерия в России в 21 веке // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2017. Т. 16, № 5(96). С. 4 - 15.

5. Покровский В.И., Онищенко Г.Г., Черкасский Б.Л. Эволюция инфекционных болезней в России в XX веке. Москва: Медицина, 2003. 664 с.

6. Чагина И.А., Борисова О.Ю., Кафарская Л.И., Афанасьев С.С., Алешкин В.А., Несвижский Ю.В., Афанасьев М.С., Алешкин А.В., Юсуф Е.В., Москвина Т.И., Пономарева Л.И., Караулов А.В. Состав популяции штаммов возбудителя дифтерии, циркулирующих в России // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2016. № 5. С. 50 - 60.

7. Чагина И.А., Переварова Ю.С., Переваров В.В., Чаплин А.В., Борисова О.Ю., Кафарская Л.И., Афанасьев С.С., Алешкин В.А. Полиморфизм гена dtxR у современных штаммов Corynebacterium diphtheriaе // Вестник Российского государственного медицинского университета. 2017. № 1. С. 34 - 41.

8. Якимова Т.Н., Маркина С.С., Максимова Н.М. Эпидситуация по дифтерии в России и в субъектах Российской Федерации с 2005 - 2011 гг. // Бюллетень Восточно-Сибирского научного центра Сибирского отделения Российской академии медицинских наук. 2012. Т. 87, № 5-1. С. 151 - 154.

9. Berger A., Meinel D.M., Schaffer A., Ziegler R., Pitteroff J., Konrad R., Sing A. A case of pharyngeal diphtheria in Germany, June 2015. Infection., 2016, vol. 44, no. 5, pp. 673 - 675.

10. Both L., Collins S., de Zoysa A., White J., Mandal S., Efstratiou A. Molecular and epidemiological review of toxigenic diphtheria infections in England between 2007 and 2013. J. Clin. Microbiol., 2015, vol. 53, no 2, pp. 567 - 572.

11. Centers for Disease Control and Prevention. Manual for the surveillance of vaccine-preventable diseases: Diphtheria. URL: https://www.cdc.gov/vaccines/pubs/surv-manual/chpt01-dip.html (Accessed August 10, 2019).

12. Kumar S., Stecher G., Li M., Knyaz C., Tamura K. MEGA X: molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms. Mol Biol Evol., 2018, vol. 35, no. 6, pp. 1547 - 1549.

13. Li L., Stoeckert C.J., Roos D.S. OrthoMCL: identification of ortholog groups for eukaryotic genomes. Genome Res., 2003, vol. 13, no. 9, pp. 2178 - 2189.

14. Nakao H., Mazurova I.K., Glushkevich T., Popovic T. Analysis of heterogeneity of Corynebacterium diphtheriae toxin gene, tox, and its regulatory element, dtxR, by direct sequencing. Res. Microbiol., 1997, vol. 148, no. 1, pp. 45 - 54.

15. Nascimento M., Sousa A., Ramirez M., Francisco A.P., Carrico J.A., Vaz C. PHYLOViZ 2.0: providing scalable data integration and visualization for multiple phylogenetic inference methods. Bioinformatics, 2017, vol. 33, no. 1, pp. 128 - 129.

16. Pan American Health Organization. Epidemiological update: Diphtheria. URL: https://www.paho.org/hq/index.php?option=com_content&view= article&id=12840:archive-by-disease-diphtheria&Itemid=42228&lang=en (Accessed August 20, 2019).

17. Skogmar S., Tham J. Severe diphtheria with neurologic and myocardial involvement in a Swedish patient: a case report. BMC Infect. Dis., 2018, vol. 18, no. 1, p. 359.

18. World Health Organization. Review of the epidemiology of diphtheria – 2000 - 2016. URL: https://www.who.int/immunization/sage/meetings/ 2017/april/presentations_background_docs/en/ (Accessed August 10, 2019).


Дополнительные файлы

1. ХАРАКТЕРИСТИКА ТОКСИГЕННЫХ ШТАММОВ Corynebacterium diphtheriae, ВЫДЕЛЕННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ РОССИИ
Тема дифтерия, C.diphtheriae, токсигенные штаммы, больные, бактерионосители, мультилокусное сиквенс-типирование
Тип Список литературы
Скачать (25KB)    
Метаданные
2. ХАРАКТЕРИСТИКА ТОКСИГЕННЫХ ШТАММОВ Corynebacterium diphtheriae, ВЫДЕЛЕННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ РОССИИ
Тема дифтерия, C.diphtheriae, токсигенные штаммы, больные, бактерионосители, мультилокусное сиквенс-типирование
Тип Данные
Посмотреть (380KB)    
Метаданные
3. ХАРАКТЕРИСТИКА ТОКСИГЕННЫХ ШТАММОВ Corynebacterium diphtheriae, ВЫДЕЛЕННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ РОССИИ
Тема дифтерия, C.diphtheriae, токсигенные штаммы, больные, бактерионосители, мультилокусное сиквенс-типирование
Тип Анализ данных
Скачать (21KB)    
Метаданные
4. ХАРАКТЕРИСТИКА ТОКСИГЕННЫХ ШТАММОВ Corynebacterium diphtheriae, ВЫДЕЛЕННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ РОССИИ
Тема дифтерия, C.diphtheriae, токсигенные штаммы, больные, бактерионосители, мультилокусное сиквенс-типирование
Тип Результаты исследования
Скачать (116KB)    
Метаданные
5. ХАРАКТЕРИСТИКА ТОКСИГЕННЫХ ШТАММОВ Corynebacterium diphtheriae, ВЫДЕЛЕННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ РОССИИ
Тема дифтерия, C.diphtheriae, токсигенные штаммы, больные, бактерионосители, мультилокусное сиквенс-типирование
Тип Результаты исследования
Скачать (72KB)    
Метаданные
6. ХАРАКТЕРИСТИКА ТОКСИГЕННЫХ ШТАММОВ Corynebacterium diphtheriae, ВЫДЕЛЕННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ РОССИИ
Тема дифтерия, C.diphtheriae, токсигенные штаммы, больные, бактерионосители, мультилокусное сиквенс-типирование
Тип Результаты исследования
Скачать (13KB)    
Метаданные
7. ХАРАКТЕРИСТИКА ТОКСИГЕННЫХ ШТАММОВ Corynebacterium diphtheriae, ВЫДЕЛЕННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ РОССИИ
Тема дифтерия, C.diphtheriae, токсигенные штаммы, больные, бактерионосители, мультилокусное сиквенс-типирование
Тип Результаты исследования
Скачать (54KB)    
Метаданные
8. ХАРАКТЕРИСТИКА ТОКСИГЕННЫХ ШТАММОВ Corynebacterium diphtheriae, ВЫДЕЛЕННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ РОССИИ
Тема дифтерия, C.diphtheriae, токсигенные штаммы, больные, бактерионосители, мультилокусное сиквенс-типирование
Тип Данные
Скачать (28KB)    
Метаданные
9. ХАРАКТЕРИСТИКА ТОКСИГЕННЫХ ШТАММОВ Corynebacterium diphtheriae, ВЫДЕЛЕННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ РОССИИ
Тема дифтерия, C.diphtheriae, токсигенные штаммы, больные, бактерионосители, мультилокусное сиквенс-типирование
Тип Данные
Скачать (19KB)    
Метаданные

Для цитирования:


Борисова О.Ю., Гадуа Н.Т., Пименова А.С., Чаплин А.В., Чагина И.А., Урбан Ю.Н., Максимова Н.М., Корженкова М.П., Афанасьев С.С., Кафарская Л.И., Афанасьев М.С., Крикун В.В., Якунина О.Ю. ХАРАКТЕРИСТИКА ТОКСИГЕННЫХ ШТАММОВ Corynebacterium diphtheriae, ВЫДЕЛЕННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ РОССИИ. Инфекция и иммунитет. 2020;. https://doi.org/10.15789/2220-7619-COT-1272

For citation:


Borisova O., Gadua N., Pimenova A., Chaplin A., Chagina I., Urban Y., Maksimova N., Korzhenkova M., Afanasiev S., Kafarskaya L., Afanasyev M., Krikun V., Yakunina O. CHARACTERIZATION OF TOXIGENIC Corynebacterium diphtheriae STRAINS ISOLATED IN RUSSIA. Russian Journal of Infection and Immunity. 2020;. (In Russ.) https://doi.org/10.15789/2220-7619-COT-1272

Просмотров: 107


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2220-7619 (Print)
ISSN 2313-7398 (Online)