Preview

Инфекция и иммунитет

Расширенный поиск

Молекулярная эпидемиология туберкулеза c множественной лекарственной устойчивостью в Монголии и Восточной Сибири: два независимых процесса распространения доминирующих штаммов

https://doi.org/10.15789/2220-7619-MEO-1368

Полный текст:

Аннотация

Монголия и Россия входят в группу стран с высоким бременем туберкулеза (ТБ). На территориях Восточной Сибири, граничащих с Монголией, распространенность ТБ, в том числе с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ), значительно превышает аналогичные показатели в европейской части России. В отличие от Монголии для территорий Восточной Сибири характерна высокая распространенность ВИЧ-инфекции. Широкое сотрудничество и культурный обмен между странами не исключает возможности трансграничной передачи M. tuberculosis. Если ВИЧ-инфекция не имеет эпидемиологического значения для Монголии в настоящий момент, то ТБ по обе стороны границы имеет схожую распространенность. Цель: оценка трансграничного распространения M. tuberculosis c множественной лекарственной устойчивостью в Монголии и регионах Восточной Сибири по молекулярно-генетическим данным. Материалы и методы. Методом MIRU-VNTR по 24 локусам проведено исследование 1045 штаммов M. tuberculosis, выделенных на территории Монголии (291) и трех регионов Восточной Сибири (754). Субтип CC2/W148 идентифицировали по наличию специфической делеции в гене kdpD, субтип СС1 — по SNP в гене pks17 в позиции 1887060. Филогенетический анализ полученных MIRU-VNTR паттернов проведен путем построения древ UPGMA и максимального правдоподобия. Результаты. Генотип Beijing присутствовал в 75,3% (219/291) коллекции из Монголии и 69,0% (520/754) — из Восточносибирских регионов России. Общими минорными являются генотипы LAM (11,0 и 15,1%), T (10,3 и 4,5%) и Haarlem (1,4 и 2,4%) соответственно в Монголии и Восточной Сибири. Только в российской выборке обнаружены генотипы S (1,3%) и Ural (5,0%). Основные эпидемические субтипы Beijing каждой из стран относились к разным клональным комплексам (СС): монгольские штаммы Beijing в превалирующем количестве имели профили 342-32, 3819-32, 177332 MLVA типов и относились к субтипу СС4; российские штаммы Beijing в основном принадлежали к субтипам СС1 (43,7% — 227/520) и CC2/W148 (34,8% — 181/520). Уровень и модели распространения МЛУ штаммов значительно отличались в Монголии и Восточной Сибири. Моделирование диссеминации эпидемических вариантов возбудителя свидетельствует о крайне незначительном вкладе явления трансграничной передачи M. tuberculosis между Монголией и Россией. Филогенетическая реконструкция эволюции субтипа CC4 генотипа Beijing в Монголии позволяет предположить, что его распространение связано в первую очередь с Китаем и другими странами Западно-Тихоокеанского региона. Прослеживаются три основных филогенетических ветви субтипа CC4, вероятно, получивших распространение на территории Монголии в XI—XII веках. Можно предполагать, что распространение эпидемического субтипа CC4 генотипа Beijing происходило в две стадии: ранняя — возникновение предковых вариантов СС4 в Монголии или занос их из Китая (они гомологичны сохранившимся в китайской популяции штаммам), поздняя — распространение за счет активного обмена M. tuberculosis со странами Юго-Восточной Азии, но не России. Заключение. Используя генотипирование MIRU-VNTR-24 и классификацию по специфическим однонуклеотидным полиморфизмам, характерным для отдельных субтипов генотипа Beijing, были описаны обособленные друг от друга закономерности распространения эпидемических вариантов возбудителя в Монголии и России. Было продемонстрировано, что возникновение и распространение ТБ с МЛУ в Монголии носит исключительно ятрогенный характер, в то время как на исследуемых территориях России значительный вклад в распространение ТБ с МЛУ вносят эпидемические субтипы генотипа Beijing (субтипы СС1 и CC2/W148).

Об авторах

С. Н. Жданова
Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека
Россия

Жданова Светлана Николаевна - доктор медицинских наук, старший научный сотрудник лаборатории эпидемиологически и социально значимых инфекций.

664003, Иркутск, ул. Тимирязева, 16.

Тел.: 8 (395) 220-76-36. Факс: 8 (395) 220-76-36



М. В. Бадлеева
Бурятский государственный университет
Россия

Кандидат медицинских наук, доцент кафедры инфекционных болезней.

Улан-Удэ.



П. А. Хромова
Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека
Россия

Младший научный сотрудник лаборатории эпидемиологически и социально значимых инфекций.

664003, Иркутск, ул. Тимирязева, 16.



О. Б. Огарков
Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека
Россия

Доктор медицинских наук, заведующий отделом эпидемиологии и микробиологии.

664003, Иркутск, ул. Тимирязева, 16.



Е. А. Орлова
Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека
Россия

Младший научный сотрудник лаборатории эпидемиологически и социально значимых инфекций.

664003, Иркутск, ул. Тимирязева, 16.



Список литературы

1. Бадлеева М.В., Жданова С.Н., Баасансурэн Э., Огарков О.Б., Эрдэнэгэрэл Н., Орлова Е.А., Оюунтуяа Т., Савилов Е.Д., Буянхишиг Б., Пунцаг Б., Нямхуу Д. Молекулярно-генетические особенности туберкулеза в Монголии и граничащих с ней регионах России // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2017. Т. 16, № 5 (96). С. 53—57.

2. Жданова С.Н., Огарков О.Б., Лац А.А., Зарбуев А.Н., Бадлеева М.В., Унтанова Л.С., Савилов Е.Д. Выявление убикви-тарных и эндемичных генотипов Mycobacterium tuberculosis на территории Республики Бурятии // Молекулярная генетика, вирусология и микробиология. 2014. № 2. С. 12—16.

3. Жданова С.Н., Огарков О.Б., Синьков В.В., Хромова П.А., Орлова Е.А., Кощеев М.Е., Савилов Е.Д. Эпидемиологическое обоснование распространения основных клонов генотипа Beijing Mycobacterium tuberculosis в Иркутской области // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2017. № 6. С. 88—94.

4. Микова О.Е., Жданова С.Н., Сергевнин В.И., Огарков О.Б., Сармометов Е.В., Варецкая Т.А., Новицкая О.Н., Хромова П.А., Савилов Е.Д., Кощеев М.Е., Шмагин Д.В. Высокая распространенность генотипа B0/W148 Mycobacterium tuberculosis у больных ВИЧ-инфекцией, сочетанной с туберкулезом, в Пермском крае и Иркутской области // Бюллетень Восточно-Сибирского научного центра Сибирского отделения Российской академии медицинских наук. 2016. Т. 1, № 5 (111). С. 142—145.

5. Buyankhishig B., Naranbat N., Mitarai S., Rieder H.L. Nationwide survey of anti-tuberculosis drug resistance in Mongolia. IJTLD, 2011, vol. 15, no. 9,pp. 1201-1205. doi: 10.5588/ijtld.10.0594

6. Dobler C.C., Korver S., Batbayar O., Nyamdulam B., Oyuntsetseg S., Tsolmon B., Surmaajav B., Bayarjargal B., Marais B.J. Multidrug-resistant tuberculosis in patients for whom first-line treatment failed, Mongolia, 2010-2011. Emerg. Infect. Dis., 2015, vol. 21, no. 8, pp. 1451-1454. doi: 10.5588/ijtld.15.0361

7. Eurasian Patent No. 032489 Russian Federation, Int. Cl. C12N 15/11 (2006.01). Oligonucleotide primers, fluorescent DNA probes and method for detecting Mycobacterium tuberculosis clonal complex 2-W148 of the Beijing genotype in clinical samples: No. 201700085; application 2017.02.03: date of publication 2019.06.28 / Ogarkov O.B., Sinkov V.V., Zhdanova S.N., Rychkova L.V. Proprietors: Federalnoe gosudarstvennoe nauchnoe uchrezhdenie “Nauchnyj centr problem zdorov'ja sem'i i reprodukcii cheloveka”. 10 p. (In Russ.).

8. European Concerted Action on new Generation Genetic Markers and Techniques for the Epidemiology and Control of Tuberculosis Beijing/W genotype Mycobacterium tuberculosis and drug resistance. Emerg. Infect. Dis., 2006, vol. 12, no. 5, pp. 736-743. doi: 10.3201/eid1205.050400

9. Ganzaya S., Naranbat N., Bissell K., Zachariah R. Countrywide audit of multidrug-resistant tuberculosis and treatment outcomes in Mongolia. Public Health Action, 2013, vol. 21, no. 3 (4), pp. 333-336. doi: 10.5588/pha.13.0052

10. Gurjav U., Burneebaatar B., Narmandakh E., Tumenbayar O., Ochirbat B., Hill-Cawthorne G.A., Marais B.J., Sintchenko V. Spatiotemporal evidence for cross-border spread of MDR-TB along the Trans-Siberian Railway line. Int. J. Tuberc. Lung Dis., 2015, vol. 19, no. 11, pp. 1376-1382. doi: 10.5588/ijtld.15.0361

11. Gurjav U., Erkhembayar B., Burneebaatar B., Narmandakh E., Tumenbayar O., Hill-Cawthorne G.A., Marais B.J., Sintchenko V. Transmission of multi-drug resistant tuberculosis in Mongolia is driven by Beijing strains of Mycobacterium tuberculosis resistant to all first-line drugs. Tuberculosis, 2016, vol. 101, pp. 49-53. doi: 10.1016/j.tube.2016.07.010

12. Merker M., Blin C., Mona S., Duforet-Frebourg N., Lecher S., Willery E., Blum M.G., Rusch-Gerdes S., Mokrousov I., Aleksic E., Allix-Beguec C., Antierens A., Augustynowicz-Kopec E., Ballif M., Barletta F., Beck H.P., Barry C.E. 3rd, Bonnet M., Borroni E., Campos-Herrero I., Cirillo D., Cox H., Crowe S., Crudu V., Diel R., Drobniewski F., Fauville-Dufaux M., Gagneux S., Ghebremichael S., Hanekom M., Hoffner S., Jiao W.W., Kalon S., Kohl T.A., Kontsevaya I., I.illebtck T., Maeda S., Nikolayevskyy V., Rasmussen M., Rastogi N., Samper S., Sanchez-Padilla E., Savic B., Shamputa I.C., Shen A., Sng L.H., Stakenas P., Toit K., Varaine F., Vukovic D., Wahl C., Warren R., Supply P., Niemann S., Wirth T. Evolutionary history and global spread of the Mycobacterium tuberculosis Beijing lineage. Nat. Genet., 2015, vol. 47, no. 3, pp. 242-249. doi: 10.1038/ng.3195

13. Mokrousov I. Mycobacterium tuberculosis phylogeography in the context of human migration and pathogen's pathobiology: Insights from Beijing and Ural families. Tuberculosis (Edinb.), 2015, vol. 95, no. 1, pp. 167-176. doi: 10.1016/j.tube.2015.02.031

14. National Statistical Office of Mongolia. Socio-Economic situation of Mongolia: monthly bulletin of statistics. Ulaanbaatar, 2019. URL: http://1212.mn/BookLibraryDownload.ashx?url=Bulletin_2019_09_eng.pdf&ln=En (17.12.2019)

15. Ogarkov O., Mokrousov I., Sinkov V., Zhdanova S., Antipina S., Savilov E. “Lethal” combination of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype and human CD209 -336G allele in Russian male population. Infect. Genet. Evol., 2012, vol. 12, no. 4, pp. 732736. doi: 10.1016/j.meegid.2011.10.005

16. Reed M.B., Pichler V.K., McIntosh F., Mattia A., Fallow A., Masala S., Domenech P., Zwerling A., Thibert L., Menzies D., Schwartzman K., Behr M.A. Major Mycobacterium tuberculosis lineages associate with patient country of origin. J. Clin. Microbiol., 2009, vol. 47, no. 4, pp. 1119-1128. doi: 10.1128/JCM.02142-08

17. Rendell N.L., Bekhbat S., Ganbaatar G., Dorjravdan M., Pai M., Dobler C.C. Implementation of the Xpert MTB/RIF assay for tuberculosis in Mongolia: a qualitative exploration of barriers and enablers. Peer J., 2017, 14 (5): e3567. doi: 10.7717/peerj.3567

18. Supply P., Allix C., Lesjean S., Cardoso-Oelemann M., Rusch-Gerdes S., Willery E., Savine E., de Haas P., van Deutekom H., Roring S., Bifani P., Kurepina N., Kreiswirth B., Sola C., Rastogi N., Vatin V., Gutierrez M.C., Fauville M., Niemann S., Skuce R., Kremer K., Locht C., van Soolingen D. Proposal for standardization of optimized mycobacterial interspersed repetitive unit-variable-number tandem repeat typing of Mycobacterium tuberculosis. J. Clin. Microbiol., 2006, vol. 44, no. 12, pp. 44984510. doi: 10.1128/JCM.01392-06

19. Shitikov E., Kolchenko S., Mokrousov I., Bespyatykh J., Ischenko D., Ilina E., Govorun V. Evolutionary pathway analysis and unified classification of East Asian lineage of Mycobacterium tuberculosis. Sci. Rep., 2017, vol. 23, no. 7 (1): e9227. doi: 10.1038/s41598-017-10018-5

20. Shitikov E., Vyazovaya A., Malakhova M., Guliaev A., Bespyatykh J., Proshina E., Pasechnik O., Mokrousov I. Simple assay for detection of the Central Asia outbreak clade of the Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype. J. Clin. Microbiol., 2019, no. 57: 00215-19. doi: 10.1128/JCM.00215-19

21. WHO. Mongolia — Tuberculosis profile. 2018. Geneva: WHO, 2018. URL: https://extranet.who.int/sree/Reports?op=Replet&name=%2FWHO_HQ_Reports%2FG2%2FPROD%2FEXT%2FTBCountryProfile&ISO2=MN&LAN=EN&outtype=html (17.12.2019)

22. Yin Q.Q., Liu H.C., Jiao W.W., Li Q.J., Han R., Tian J.L., Liu Z.G., Zhao X.Q., Li Y.J., Wan K.L., Shen A.D., Mokrousov I. Evolutionary history and ongoing transmission of phylogenetic sublineages of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype in China. Sci. Rep., 2016, vol. 6: e34353 doi: 10.1038/srep34353


Дополнительные файлы

Для цитирования:


Жданова С.Н., Бадлеева М.В., Хромова П.А., Огарков О.Б., Орлова Е.А. Молекулярная эпидемиология туберкулеза c множественной лекарственной устойчивостью в Монголии и Восточной Сибири: два независимых процесса распространения доминирующих штаммов. Инфекция и иммунитет. 2021;11(2):337-348. https://doi.org/10.15789/2220-7619-MEO-1368

For citation:


Zhdanova S.N., Badleeva M.V., Khromova P.A., Ogarkov O.B., Orlova E.A. Molecular epidemiology of multidrug resistant tuberculosis in Mongolia and Eastern Siberia: two independent dissemination processes for dominant strains. Russian Journal of Infection and Immunity. 2021;11(2):337-348. (In Russ.) https://doi.org/10.15789/2220-7619-MEO-1368

Просмотров: 237


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2220-7619 (Print)
ISSN 2313-7398 (Online)