Preview

Инфекция и иммунитет

Расширенный поиск

Молекулярная эпидемиология туберкулеза c множественной лекарственной устойчивостью в Монголии и Восточной Сибири: два независимых процесса распространения доминирующих штаммов

https://doi.org/10.15789/2220-7619-MEO-1368

Полный текст:

Аннотация

Монголия и Россия входят в группу стран с высоким бременем туберкулеза (ТБ). На территориях Восточной Сибири, граничащих с Монголией, распространенность ТБ, в том числе с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ), значимо превышает аналогичные показатели в европейской части России. В отличие от Монголии для территорий Восточной Сибири характерна высокая распространенность ВИЧ-инфекции. Широкое сотрудничество и культурный обмен между странами не исключает возможности трансграничной передачи M. tuberculosis. Если ВИЧ-инфекция не имеет эпидемиологического значения для Монголии в настоящий момент, то ТБ по обе стороны границы имеет схожую распространенность. Цель: оценка трансграничного распространения M. tuberculosis c множественной лекарственной устойчивостью в Монголии  и регионах Восточной Сибири по молекулярно-генетическим данным. Материалы и методы:  Методом MIRU-VNTR по 24 локусам проведено исследование 1045 штаммов M. tuberculosis, выделенных на территории Монголии (291) и трех регионов Восточной Сибири (754). Субтип CC2/W148 идентифицировали по наличию специфической делеции в kdpD гене, субтип СС1 – по SNP в гене pks17 в позиции 1887060. Филогенетический анализ полученных MIRU-VNTR паттернов проведен путем построения древ UPGMA и максимального правдоподобия. Результаты исследования. Генотип Beijing  присутствовал в 75,3% (219/291) коллекции из Монголии и 69,0% (520/754) – из Восточносибирских регионов России. Общими минорными являются генотипы LAM (11,0% и 15,1%), T (10,3%  и 4,5% ) Haarlem (1,4% и 2,4% ) соответственно в Монголии и Восточной Сибири. Только в российской выборке обнаружены генотипы S (1,3% )  и Ural (5,0 %). Основные эпидемические субтипы Beijing  каждой из стран относились к разным клональным комплексам (СС):  монгольские штаммы Beijing в превалирующем количестве имели профили   342-32, 3819-32, 1773-32 MLVA типов и относились к СС4 субтипу; российские штаммы Beijing в основном принадлежали СС1 (43,7% - 227/520) и СС2/W148 (34,8% - 181/520) субтипам. Уровень и модели распространения МЛУ штаммов значительно отличались в Монголии и Восточной Сибири. Моделирование диссеминации эпидемических вариантов возбудителя свидетельствует о крайне незначительном вкладе явления трансграничной передачи M. tuberculosis между Монголией и Россией. Филогенетическая реконструкция эволюции субтипа CC4 генотипа Beijing в Монголии позволяет предположить, что его распространение связано в первую очередь с Китаем и другими странами Западно-Тихоокеанского региона. Прослеживаются три основных филогенетических ветви субтипа CC4, вероятно получивших распространение на территории Монголии в 11-12  веках. Можно предполагать, что распространение эпидемического субтипа CC4 генотипа Beijing происходило в две стадии: ранняя – возникновение предковых вариантов СС4 в Монголии или занос их из Китая (они гомологичны сохранившимся в китайской популяции  штаммам);  поздняя – распространения  за счет активного обмена M. tuberculosis со странами Юго-Восточной Азии, но не России. Заключение.  Используя генотипирование MIRU-VNTR 24 и классификацию по специфическим однонуклеотидным полиморфизмам, характерным для отдельных субтипов генотипа Beijing, были описаны обособленные друг от друга закономерности распространения эпидемических вариантов возбудителя в Монголии и России.  Было продемонстрировано, что возникновение и распространение ТБ с МЛУ в Монголии носит исключительно ятрогенный характер, в то время как на исследуемых территориях России значительный вклад в распространения МЛУ туберкулеза вносят эпидемические субтипы генотипа Beijing (субтипы СС1 и СС2/W148).

Об авторах

С. Н. Жданова
ФГБНУ «Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека»
Россия
старший научный сотрудник лаборатории эпидемиологически и социально значимых инфекций


М. В. Бадлеева
ФГБОУ ВО Бурятский государственный университет
Россия
доцент кафедры инфекционных болезней


О. Б. Огарков
ФГБНУ «Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека»
Россия
заведующий отделом эпидемиологии и микробиологии


Е. А. Орлова
ФГБНУ «Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека»
Россия
младший научный сотрудник лаборатории эпидемиологически и социально значимых инфекций


Список литературы

1. Badleyeva M.V., Zhdanov S.N., Baasansuren E., Ogarkov O.B. Erdenegerel N., Orlova E.A., Oyuntuyaa T., Savilov E.D., Buyanhishig B., Puntsag B., Nyamhuu D. Molecular-Genetic Features of Tuberculosis in Mongolia and in Russian Bordering Regions. Еpidemiologiа i vakcinoprofilaktika, 2017, vol. 16., no. 5 (96), pp.53-57

2. https://elibrary.ru/item.asp?id=30 459999

3. Zhdanova S.N., Ogarkov O.B., Laz A.A., Zarbuev A.N., Badleeva M.V., Untanova L.S., Savilov E.D. Identification of ubiquitous and endemic Mycobacterium tuberculosis genotypes in the republic of Buryatia. Molecular Genetics, Microbiology and Virology, 2014, vol. 29, no. 2, pp. 58-62. https://elibrary.ru/item.asp?id=22267973

4. Zhdanova S.N., Ogarkov O.B., Sinkov V.V. , Khromova P.A., Orlova E.A., Koshcheev M.E., Savilov E.D. Epidemiological study of main clones distribution genotype Beijing of Mycobacterium tuberculosis within Irkutsk region. Journal of Microbiology Epidemiology and Immunobiology, 2017, no. 6, pp.88-94. https://elibrary.ru/item.asp?id=37136208

5. Mikova O.E., Zhdanova S.N., Sergevnin V.I, Ogarkov O.B., Sarmometov T.V., Varetskaya T.A., Novitskaya O.N., Chromova P.A., Savilov E.D., Koshcheev M.Y., Shmagin D.V. High prevalence of genotype B0/W148 of Mycobacterium tuberculosis among HIV-TB patients in Perm Krai and Irkutsk Region. Bulletin of the East Siberian Scientific Center of the Siberian Branch of the Russian Academy of Medical Sciences. 2016, vol. 1. no. 5 (111). pp. 142-145.

6. https://elibrary.ru/item.asp?id=27193034

7. Buyankhishig, B., Naranbat, N., Mitarai, S., & Rieder, H. L. Nationwide survey of anti-tuberculosis drug resistance in Mongolia. The International Journal of Tuberculosis and Lung Disease, 2011, vol.15, no.9, pp. 1201–1205. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21943846 [doi:10.5588/ijtld.10.0594]

8. Dobler C.C., Korver S., Batbayar O., Nyamdulam B., Oyuntsetseg S., Tsolmon B., Surmaajav B., Bayarjargal B., Marais B.J. 2015. Multidrug-resistant tuberculosis in patients for whom first-line treatment failed, Mongolia, 2010-2011. Emerging Infectious Diseases, 2015, vol. 21, no 8, pp1451-1454. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26467591

9. [doi: 10.5588/ijtld.15.0361]

10. European Concerted Action on New Generation Genetic Markers and Techniques for the Epidemiology and Control of Tuberculosis. “Beijing/W genotype Mycobacterium tuberculosis and drug resistance.” Emerging infectious diseases vol. 12,5 (2006): 736-43. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16704829

11. [doi:10.3201/eid1205.050400]

12. Ganzaya S., Naranbat N., Bissell K., Zachariah R. Countrywide audit of multidrug-resistant tuberculosis and treatment outcomes in Mongolia. Public Health Action. 2013, vol. 21, no3(4), pp. 333-336 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4463161

13. [doi: 10.5588/pha.13.0052]

14. Gurjav U., Burneebaatar B., Narmandakh E., Tumenbayar O., Ochirbat B., Hill-Cawthorne G.A., Marais B.J., Sintchenko V. Spatiotemporal evidence for cross-border spread of MDR-TB along the Trans-Siberian Railway line. Int. J. Tuberc. Lung Dis., 2015. vol. 19, no 11, pp. 1376-1382. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26467591

15. [doi: 10.5588/ijtld.15.0361]

16. Gurjav U., Erkhembayar B., Burneebaatar B., Narmandakh E., Tumenbayar O., Hill-Cawthorne G.A., Marais B.J., Sintchenko V. Transmission of multi-drug resistant tuberculosis in Mongolia is driven by Beijing strains of Mycobacterium tuberculosis resistant to all first-line drugs. Tuberculosis, 2016, vol.101, pp. 49-53. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27865397

17. [doi: 10.1016/j.tube.2016.07.010]

18. Eurasian Patent № 032489 Олигонуклеотидные праймеры, флуоресцентные Днк-зонды и способ выявления Mycobacterium tuberculosis клонального комплекса 2 - W148 генотипа Beijing в клинических образцах Eurasian Patent № 032489 Oligonucleotide primers, fluorescent DNA probes and method for detecting Mycobacterium tuberculosis clonal complex 2 - W148 of the Beijing genotype in clinical samples https://www.eapo.org/en/publications/publicat/viewpubl.php?id=032489

19. Merker M, Blin C, Mona S, Duforet-Frebourg N, Lecher S, Willery E, Blum MG, Rüsch-Gerdes S, Mokrousov I, Aleksic E, Allix-Béguec C, Antierens A, Augustynowicz-Kopeć E, Ballif M, Barletta F, Beck HP, Barry CE 3rd, Bonnet M, Borroni E, Campos-Herrero I, Cirillo D, Cox H, Crowe S, Crudu V, Diel R, Drobniewski F, Fauville-Dufaux M, Gagneux S, Ghebremichael S, Hanekom M, Hoffner S, Jiao WW, Kalon S, Kohl TA, Kontsevaya I, Lillebæk T, Maeda S, Nikolayevskyy V, Rasmussen M, Rastogi N, Samper S, Sanchez-Padilla E, Savic B, Shamputa IC, Shen A, Sng LH, Stakenas P, Toit K, Varaine F, Vukovic D, Wahl C, Warren R, Supply P, Niemann S, Wirth T. Evolutionary history and global spread of the Mycobacterium tuberculosis Beijing lineage. Nat. Genet., 2015, vоl. 47, no. 3, pp. 242-249 https://www.nature.com/articles/ng.3195

20. [doi: 10.1038/ng.3195]

21. Mokrousov I. Mycobacterium tuberculosis phylogeography in the context of human migration and pathogen's pathobiology: Insights from Beijing and Ural families. Tuberculosis (Edinb), 2015, vol. 95, Suppl. 1, pp. 167-176. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25754342

22. [doi: 10.1016/j.tube.2015.02.031]

23. National Statistical Office of Mongolia. Socio-Economic situation of Mongolia http://1212.mn/BookLibraryDownload.ashx?url=Bulletin_2019_09_eng.pdf&ln=En (accessed on 17 December 2019)

24. Ogarkov O., Mokrousov I., Sinkov V., Zhdanova S., Antipina S., Savilov E. ‘Lethal’ combination of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype and human CD209 -336G allele in Russian male population. Infect. Genet. Evol., 2012, vol.12, no. 4, pp. 732-736.

25. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22027159

26. [doi: 10.1016/j.meegid.2011.10.005]

27. Reed M.B., Pichler V.K., McIntosh F., Mattia A., Fallow A., Masala S. et al. Major Mycobacterium tuberculosis lineages associate with patient country of origin. J. Clin. Microbiol., 2009, vol. 47, no 4, pp. 1119-1128. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19213699

28. [doi: 10.1128/JCM.02142-08]

29. Rendell N.L., Bekhbat S., Ganbaatar G., Dorjravdan M., Pai M., Dobler C.C. Implementation of the Xpert MTB/RIF assay for tuberculosis in Mongolia: a qualitative exploration of barriers and enablers. Peer J., 2017, vol. 14, no. 5, e3567 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28717600

30. [doi: 10.7717/peerj.3567]

31. Supply P., Allix C., Lesjean S., Cardoso-Oelemann M., Rüsch-Gerdes S., Willery E., Savine E. et al. Proposal for standardization of optimized mycobacterial interspersed repetitive unit-variable-number tandem repeat typing of Mycobacterium tuberculosis. J. Clin. Microbiol., 2006, vol. 44, no. 12, pp. 4498-4510. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17005759

32. [doi:10.1128/JCM.01392-06]

33. Shitikov E., Kolchenko S., Mokrousov I., Bespyatykh J., Ischenko D., Ilina E., Govorun V. Evolutionary pathway analysis and unified classification of East Asian lineage of Mycobacterium tuberculosis. Sci. Rep., 2017, vol. 23, no. 7(1), e 9227. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5569047

34. [doi: 10.1038/s41598-017-10018-5]

35. Shitikov E, Vyazovaya A, Malakhova M,Guliaev A, Bespyatykh J, Proshina E, Pasechnik O, Mokrousov I. Simple assay for detection of the Central Asia outbreak clade of the Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype. J. Clin. Microbiol., 2019, no. 57, pp. 00215-19. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6595453

36. [doi: 10.1128/JCM.00215-19]

37. World Health Organization. 2018. Mongolia—Tuberculosis profile. World Health Organization, Geneva, Switzerland. https://extranet.who.int/sree/Reports?op=Replet&name=%2FWHO_HQ_Reports%2FG2%2FPROD%2FEXT%2FTBCountryProfile&ISO2=MN&LAN=EN&outtype=html (accessed on 17 December 2019).

38. Yin, Q., Liu, H., Jiao, W. et al. Evolutionary History and Ongoing Transmission of Phylogenetic Sublineages of Mycobacterium tuberculosis Beijing Genotype in China. Sci Rep., 2016, vol. 6. e34353 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5041183

39. [doi: 10.1038/srep34353]


Дополнительные файлы

1. Метаданные
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Скачать (15KB)    
Метаданные
2. титульный лист
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Скачать (19KB)    
Метаданные
3. резюме
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Скачать (15KB)    
Метаданные
4. Рисунок 1
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Скачать (799KB)    
Метаданные
5. Рисунок 2
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Скачать (402KB)    
Метаданные
6. Список рисунков
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Скачать (11KB)    
Метаданные
7. Таблица 1
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Скачать (13KB)    
Метаданные
8. Таблица 2
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Скачать (12KB)    
Метаданные
9. Таблица 3
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Скачать (12KB)    
Метаданные
10. Таблица 4
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Скачать (14KB)    
Метаданные
11. Список таблиц
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Скачать (11KB)    
Метаданные
12. Литература
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Скачать (22KB)    
Метаданные
13. Подписи авторов
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Метаданные
14. Текст статьи отредактированный
Тема
Тип Прочее
Скачать (38KB)    
Метаданные
15. резюме отредактированное
Тема
Тип Прочее
Скачать (20KB)    
Метаданные
16. Литература отредактированная
Тема
Тип Прочее
Скачать (23KB)    
Метаданные
17. титульный лист отредактированный
Тема
Тип Прочее
Скачать (19KB)    
Метаданные
18. Таблица 2 отредактированная
Тема
Тип Прочее
Скачать (12KB)    
Метаданные
19. Список таблиц отредактированный
Тема
Тип Прочее
Скачать (11KB)    
Метаданные
20. ответы на вопросы рецензентов
Тема
Тип Прочее
Скачать (24KB)    
Метаданные
21. отредактированный список таблиц
Тема
Тип Прочее
Скачать (11KB)    
Метаданные
22. отредактированный рисунок 2
Тема
Тип Прочее
Скачать (57KB)    
Метаданные
23. таблица 4
Тема
Тип Прочее
Скачать (14KB)    
Метаданные
24. в издательство
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Скачать (57KB)    
Метаданные

Для цитирования:


Жданова С.Н., Бадлеева М.В., Огарков О.Б., Орлова Е.А. Молекулярная эпидемиология туберкулеза c множественной лекарственной устойчивостью в Монголии и Восточной Сибири: два независимых процесса распространения доминирующих штаммов. Инфекция и иммунитет. 2020;. https://doi.org/10.15789/2220-7619-MEO-1368

For citation:


Zhdanova S., Badleeva M., Ogarkov O., Orlova E. MOLECULAR EPIDEMIOLOGY OF MULTIDRUG RESISTANT TUBERCULOSIS IN MONGOLIA AND EASTERN SIBERIA: TWO INDEPENDENT DISSEMINATION PROCESSES FOR DOMINANT STRAINS. Russian Journal of Infection and Immunity. 2020;. (In Russ.) https://doi.org/10.15789/2220-7619-MEO-1368

Просмотров: 84


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2220-7619 (Print)
ISSN 2313-7398 (Online)