Preview

Инфекция и иммунитет

Расширенный поиск

Механизмы антибиотикорезистентности основных возбудителей гнойно-воспалительных осложнений у онкологических больных

https://doi.org/10.15789/2220-7619-TMO-1379

Полный текст:

Аннотация

Цель работы — изучение механизмов антибиотикорезистентности основных возбудителей гнойно-воспалительных осложнений у онкологических больных. Материалы и методы. В 2012—2015 гг. проспективно обследовано 184 онкологических больных: 67 больных хирургического отделения № 1 и 117 больных отделения анестезиологии-реанимации Красноярского краевого клинического онкологического диспансера им. А.И. Крыжановского. Материал от больных — бронхоальвеолярная лаважная жидкость, раневое отделяемое — исследовали бактериологическим методом, а также MALDI-TOF. Для изучения антибиотикочувствительности применяли такие методы, как диско-диффузионный, метод «двойных дисков», инактивации карбапенемов, скрининга, ПЦР, Е-тест, метод серийных разведений в бульоне Мюллера-Хинтон. Генотипирование и определение механизмов резистентности осуществлялось с помощью ПЦР, М-ПЦР, секвенирования. Была использована программа WHONET, уровень значимости p < 0,05. Результаты. Установлено превалирование ассоциаций мультирезистентных и экстремально резистентных возбудителей. В микрофлоре нижних отделов дыхательных путей, раневом отделяемом у онкологических больных превалировали неферментирующие грамотрицательные бактерии — 44,5 и 48% соответственно, а также представители порядка Enterobacterales — 24 и 34,9% соответственно; грамположительные бактерии — 24 и 17,1% соответственно. У штаммов P. aeruginosa и A. baumannii, K. pneumoniae, устойчивых к имипенему и/или меропенему, проверяли продукцию МБЛ фенотипически, а также наличие генов наиболее распространенных VIM-, IMP-типов, а у A. baumanni iтакже генов OXA-23, OXA-40, OXA-58; у K. pneumoniae — OXA-48. Штаммы A. baumannii не образуют МБЛ, но 56,3% изолятов (9 штаммов из 16) являлись продуцентами карбапенемаз OXA-23 и OXA-40. Штаммы P. aeruginosa 15,0% (3 из 20) обладали VIM. 16,7% (1 из 6) изолятов K. pneumoniae являлся продуцентом OXA-48. Удельный вес метициллин-резистентных штаммов рода Staphylococcus составил 48,9%, 4 штамма относились к MRSA. Штаммы MRSA PVL- относились к клонам ST239/spa3(t037)/SCCmecIIIA/tst,sek,seq+ (75%) и ST8/spa1(t008)/SCCmecIVc/sea+ (25%). MRSA ST239 резистентны к аминогликозидам (aacA-aphD, aadD), линкозамидам/макролидам (ermA), фторхинолонам (мутации GyrA — Ser84Leu; в GrlA — Ser80Phe), рифампицину (мутации rpoB — His481Asn, Ile527Met), сульфаметоксазолу, тетрациклину (tetM), а также к хлорамфениколу (у 66,7% изолятов cat); чувствительны к ванкомицину (МПК 1,0 мкг/мл), линезолиду в 100% случаев. MRSA ST8 устойчивы к аминогликозидам (aacA-aphD, aadD), линкозамидам/макролидам (ermC), тетрациклинам (tetK), хлорамфениколу (cat); 100% чувствительны к фторхинолонам, рифампицину, сульфаметаксазолу, ванкомицину (МПК 1,0 мкг/мл), даптомицину, линезолиду. Выводы. Установлено, что представители порядка Enterobacterales, А. baumannii, P. aeruginosa, MRSA сохраняют высокую антибиотикорезистентность, механизмы которой связаны с мутациями, в том числе с изменением мишени действия, наличием генов, обеспечивающих продукцию модифицирующих ферментов, инактивацию антибактериального препарата, защиту рибосом.

Об авторах

О. Е. Хохлова
Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого Министерства здравоохранения Российской Федерации
Россия

Хохлова Ольга Евгеньевна - доктор биологических наук, доцент кафедры микробиологии им. доц. Б.М. Зельмановича.

660022, Красноярск, ул. Партизана Железняка, 1.

Тел.: 8 (391) 220-13-61 (раб.); 8 (908) 018-99-84 (моб.)



И. А. Ларионова
Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого Министерства здравоохранения Российской Федерации
Россия

Старший преподаватель кафедры микробиологии им. доц. Б.М. Зельмановича.

660022, Красноярск, ул. Партизана Железняка, д. 1.

Тел. 8 908 018 99 84; тел. +7 (391) 220-13-61



О. В. Перьянова
Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого Министерства здравоохранения Российской Федерации
Россия

Кандидат биологических наук, заведующий кафедрой микробиологии им. доц. Б.М. Зельмановича.

660022, Красноярск, ул. Партизана Железняка, д. 1.

Тел. +7 (391) 220-13-61; 8 913 569 83 68



Р. С. Козлов
Смоленский государственный медицинский университет Министерства здравоохранения России
Россия

Доктор медицинских наук, профессор, член-корреспондент РАН, ректор.

214019, Смоленская обл., Смоленск, ул. Крупской, 28.

Тел. +7 (481) 255 02 75



М. В. Эйдельштейн
Смоленский государственный медицинский университет Министерства здравоохранения России
Россия

Кандидат биологических наук, заведующий лабораторией НИИ антимикробной химиотерапии.

214019, Смоленская обл., Смоленск, ул. Крупской, 28.

Тел. +7 (481) 255 02 75



А. А. Модестов
Красноярский краевой клинический онкологический диспансер имени А.И. Крыжановского
Россия

Кандидат медицинских наук, главный врач.

660133 Красноярский край, Красноярск, ул. 1-я Смоленская, 16.

Тел.: 222-40-01



О. Г. Еремеева
Красноярский краевой клинический онкологический диспансер имени А.И. Крыжановского
Россия

Врач анестезиолог-реаниматолог, заведующий отделением анестезиологии-реанимации.

660133 Красноярский край, Красноярск, ул. 1-я Смоленская, 16.

Тел.: 222-40-01



И. В. Лазарева
Детский научно-клинический центр инфекционных болезней ФМБА
Россия

Научный сотрудник отдела медицинской микробиологии и молекулярной эпидемиологии.

197022, Санкт-Петербург.



Д. Н. Акушева
Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого Министерства здравоохранения Российской Федерации
Россия

Преподаватель кафедры микробиологии им. доц. Б.М. Зельмановича.

660022, Красноярск, ул. Партизана Железняка, д. 1.



Т. И. Лобова
Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого Министерства здравоохранения Российской Федерации
Россия

Кандидат биологических наук, старший преподаватель кафедры микробиологии им. доц. Б.М. Зельмановича.

660022, Красноярск, ул. Партизана Железняка, д. 1.



Н. К. Поткина
Российско-Японский центр микробиологии, метагеномики и инфекционных заболеваний
Россия

Научный сотрудник.

660022, Красноярск, ул. Партизана Железняка, д. 1.

Тел. 8 950 401 97 47



С. В. Сидоренко
Детский научно-клинический центр инфекционных болезней ФМБА
Россия

Доктор медицинских наук, профессор, руководитель отдела медицинской микробиологии и молекулярной эпидемиологии.

197022, Санкт-Петербург, ул. Профессора Попова, д.9.

Тел. +7(812) 234-16-70



Т. Ямамото
Международный медицинский образовательно-исследовательский центра (IMERC); Российско-Японский центр микробиологии, метагеномики и инфекционных заболеваний
Япония

Кандидат медицинских наук, профессор, директор Международного медицинского образовательно-исследовательского центра (IMERC); куратор Российско-Японского центра микробиологии, метагеномики и инфекционных заболеваний.

Ниигата; Красноярск.



Список литературы

1. Белоусова Т.А. Инфекционные осложнения в колоректальной хирургии // Вопросы онкологии. 2012. Т. 58, № 6. С. 736—743.

2. Григорьевская З.В., Петухова И.Н., Багирова Н.С., Шильникова И.И., Терещенко И.В., Григорьевский Е.Д., Дмитриева Н.В. Нозокомиальные инфекции у онкологических больных: проблема нарастающей резистентности грамотрицательных микроорганизмов // Сибирский онкологический журнал. 2017. Т. 16, № 1. С. 91—97.

3. Давыдов М.И., Дмитриева Н.В. Инфекции в онкологии. М.: Практическая медицина, 2009. 472 с.

4. Дмитриева Н.В., Петухова И.Н. Инфекционные осложнения в онкологической клинике // Практическая онкология. 2001. Т. 2, № 1 (5). С. 18-20.

5. Дмитриева Н.В., Эйдельштейн М.В., Агинова В.В., Григорьевская З.В., Петухова И.Н., Терещенко И.В., Багирова Н.С., Дьякова С.А., Калинчук Т.А., Дмитриева А.И., Шек Е.А., Склеенова Е.Ю. Инфекции, вызванные Acinetobacter bau-mannii, у онкологических больных // Сибирский онкологический журнал. 2019. Т. 18, № (3). С. 26-33.

6. Дрие Л., Броссье Ф., Сугаков В., Жарлье В. Фенотипическое определение Enterobacter — продуцентов в-лактамаз расширенного спектра: обзор и руководство по проведению испытаний // Клиническая микробиология и инфекционные заболевания. 2008. Т. 14 (Прил. 1). С. 90-103.

7. Карабак В.И. Микробиологический мониторинг за возбудителями нозокомиальных инфекций (на примере отделений реанимации и интенсивной терапии) // Антибиотики и химиотерапия. 2000. Т. 45, № 3. С. 20-23.

8. Лазарева И.В., Агеевец В.А., Ершова Т.А., Зуева Л.П., Гончаров А.Е., Дарьина М.Г., Светличная Ю.С., Усков А.Н., Сидоренко С.В. Распространение и антибактериальная резистентность грамотрицательных бактерий, продуцентов карбапенемаз, в Санкт-Петербурге и некоторых других регионах Российской Федерации // Антибиотики и химиотерапия. 2000. Т. 61. С. 11-12.

9. Практическое руководство по антиинфекционной химиотерапии / Под ред. Л.С. Страчунского, Ю.Б. Белоусова, С.Н. Козлова. 2007. URL: http://www.antibiotic.ru/ab/index.shtml (25.11.2020)

10. Сидоренко С.В., Резван С.П., Еремина Л.В. Этиология тяжелых госпитальных инфекций в отделениях реанимации и антибиотикорезистентность среди их возбудителей // Антибиотики и химиотерапия. 2005, Т. 50, № 2-3. С. 33-41.

11. Туркутюков В.Б. Молекулярно-генетический мониторинг резистентности микроорганизмов к антибиотикам // Тихоокеанский медицинский журнал. 2011. № 2. С. 28-31.

12. Хирургические инфекции: руководство / Под ред. И.А. Ерюхина, Б.Р. Гельфанда, С.А. Шляпникова. СПб.: Питер, 2003. 864 с.

13. Хохлова О.Е., Перьянова О.В., Боброва О.П., Сергеева В.В., Модестов А.А., Еремеева О.Г., Поткина Н.К., Капшук Д.Н., Алабушева А.В., Дыхно Ю.А., Ямамото Т. Микробиологический мониторинг гнойных осложнений у онкологических больных // Вопросы онкологии. 2018. Т. 64, № 1. С. 121-125.

14. Яковлев С.В. Госпитальные инфекции, вызванные резистентными грамотрицательными микроорганизмами, клиническое значение и современные возможности терапии // Инфекции и антимикробная терапия. 2004. Т. 6, № 4. С. 133-136.

15. Akiyoshi T., Ueno M., Fukunaga Y., Nagayama S., Fujimoto Y., Konishi T., Kuroyanagi H., Yamaguchi T. Effect of body mass index on short-term outcomes of patients undergoing laparoscopic resection for colorectal cancer: a single institution experience in Japan. Surg. Laparosc. Endosc. Percutan. Tech., 2011, vol. 21, pp. 409—414. doi: 10.1097/SLE.0b013e31822e5fdc

16. Alberti C., Brun-Buisson C., Burchardi H., Martin C., Goodman S., Artigas A., Sicignano A., Palazzo M., Moreno R., Boulme R., Lepage E., Gall Le R. Epidemiology of sepsis and infection in ICU patients from an international multicentre cohort study. Intens. Care Med, 2002, vol. 28, pp. 108-121. doi: 10.1007/s00134-001-1143-z

17. Avritscher E.B., Cooksley C.D., Rolston K.V., Swint J.M., Delclos G.L., Franzini L., Swisher S.G., Walsh G.L., Mansfield P.F., Elting L.S. Serious postoperative infections following resection of common solid tumors: outcomes, costs, and impact of hospital surgical volume. Support. Care Cancer, 2014, no. 22, pp. 527-535. doi: 10.1007/s00520-013-2006-1

18. Choi S.M., Kim S.H., Kim H.J., Lee D.G., Choi J.H., Yoo J.H., Kang J.H., Shin W.S., Kang M.W. Multiplex PCR for the detection of genes encoding aminoglycoside modifying enzymes and methicillin resistance among Staphylococcus species. J. Korean Med. Sci., 2003, vol. 18, no. 5, pp. 631-636. doi: 10.3346/jkms.2003.18.5.631

19. David M.Z., Daum R.S. Community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus: epidemiology and clinical consequences of an emerging epidemic. Clin. Microbiol. Rev., 2010, vol. 23, no. 3, pp. 616-687. doi: 10.1128/CMR.00081-09

20. Ellington M.J., Hope R., Livermore D.M., Kearns A.M., Henderson K., Cookson B.D., Pearson A., Johnson A.P. Decline of EMRSA-16 amongst methicillin-resistant Staphylococcus aureus causing bacteraemias in the UK between 2001 and 2007. J. Antimicrob. Chemother., 2010, vol. 65, no. 3, pp. 446-448. doi: 10.1093/jac/dkp448

21. Evans B.A., Amyes S.G. OXA Р-Lactamases. Clin. Microbiol. Rev, 2014, vol. 27, no. 2, pp. 241-263. doi: 10.1128/CMR.00117-13

22. Fagon J.Y., Chastre J., Vuagnat A., Trouillet J.L., Novara A., Gibert C. Nosocomial pneumonia and mortality among patients in intensive care units. JAMA, 1996, vol. 275, no. 11, pp. 866-869. doi:10.1001/jama.1996.03530350048033

23. Falagas M.E., Bakossi A., Pappas V.D., Holevas P.V., Bouras A., Stamata E. Secular trends of blood isolates in patients from a rural area population hospitalized in a tertiary center in a small city in Greece. BMC Microbiol., 2006, vol. 6, no. 1: 41. doi: 10.1186/14712180-6-41

24. International Working Group on the Classification of Staphylococcal Cassette Chromosome Elements (IWG-SCC). Classification of staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec): guidelines for reporting novel SCCmec elements. Agents Chemother., 2009, vol. 53, pp. 4961-4967. doi: 10.1128/AAC.00579-09

25. Johnson A.P., Pearson A., Duckworth G. Surveillance and epidemiology of MRSA bacteraemia in the UK. J. Antimicrob. Chemother., 2005, vol. 56, no. 3, pp. 455-462. doi: 10.1093/jac/dki266

26. Khokhlova O.E., Hung W.C., Wan T.W., Iwao Y., Takano T., Higuchi W., Yachenko S.V., Teplyakova O.V., Kamshilova V.V., Kotlovsky Y.V., Nishiyama A., Reva I.V., Sidorenko S.V., Peryanova O.V., Reva G.V., Teng L.J., Salmina A.B., Yamamoto T. Healthcare- and community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and fatal pneumonia with pediatric deaths in Krasnoyarsk, Siberian Russia: unique MRSA's multiple virulence factors, genome, and stepwise evolution. PLoS One, 2015, vol. 1, pp. 1-30. doi: 10.1371/journal.pone.0128017

27. Kondo Y., Ito T., Ma X.X., Watanabe S., Kreiswirth B.N., Etienne J., Hiramatsu K. Combination of multiplex PCRs for staphylococcal cassette chromosome mec type assignment: rapid identification system for mec, ccr, and major differences in junkyard regions. Antimicrob. Agents Chemother., 2007, vol. 51, pp. 264-274. doi: 10.1128/AAC.00165-06

28. Lee H.G., Jang J., Choi J.E. Blood stream infections in patients in the burn intensive care unit. Infect. Chemother., 2013, vol. 45, no. 2, pp. 194-201. doi: 10.3947/ic.2013.45.2.194

29. Mandel G.L. Principles and practice of infections diseases. 9th ed. London: Churchill Livingstone, 2019. 4176 р.

30. Mariani-Kurkdjian P., Doit C., Bingen E. Extended-spectrum beta-lactamase producing-enterobacteriaceae. Arch. Pediatr., 2012, no. 3, pp. 93-96. doi: 10.1016/S0929-693X(12)71280-0

31. Martineau F., Picard F.J., Lansac N., Menard C., Roy P.H., Ouellette M., Bergeron M.G. Correlation between the resistance genotype determined by multiplex PCR assays and the antibiotic susceptibility patterns of Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis. Antimicrob. Agents Chemother., 2000, vol. 44, no. 2, pp. 231-238. doi: 10.1128/aac.44.2.231-238.2000

32. McManus B.A., Coleman D.C., Deasy E.C., Brennan G.I., Connell B.O., Monecke S., Ehricht R., Leggett B., Leonard N., Shore A.C. Comparative genotypes, staphylococcal cassette chromosome mec (sccmec) genes and antimicrobial resistance amongst Staphylococcus epidermidis and Staphylococcus haemolyticus isolates from infections in humans and companion animals. PLoS One, 2015, no. 9, pp. 1-18. doi: 10.1371/journal.pone.0138079

33. Peleg A.Y., Seifert H., Paterson D.L. Acinetobacter baumannii: emergence of a successful pathogen. Clin. Microbiol. Rev., 2008, no. 21, pp. 538-582. doi: 10.1128/CMR.00058-07

34. Pulcini C., Binda F., Lamkang A.S., Trett A., Charani E. Developing core elements in checklist items fro global hospital antimicrobial stewardship programmes: a consensus approach. Clin. Microbiol. Inf., 2019, vol. 25, no. 1, pp. 20-25. doi: 10.1016/j.cmi.2018.03.033

35. Ray S., Anand D., Purwar S., Samanta A., Upadhey K.V. Association of high mortility with extended-spectrum-beta-lacta-mases (ESBL) positive cultures in community aquired infections. J. Critical Care, 2018, no. 44, pp. 255-260. doi: 10.1016/j.jcrc.2017.10.036

36. Rolston K.V., Nesher L., Tarrand T.J. Current microbiology of surgical site infections in patients with cancer: a retrospective review. Inf. Dis. Ther., 2014, no. 3, pp. 245-256. doi: 10.1007/s40121-014-0048-4

37. Takano T., Higuchi W., Zaraket H., Otsuka T., Baranovich T., Enany S., Saito K., Isobe H., Dohmae S., Ozaki K., Takano M., Iwao Y., Shibuya M., Okubo T., Yabe S., Shi D., Reva I., Teng L.J., Yamamoto T. Novel characteristics of community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains belonging to multilocus sequence type 59 in Taiwan. Antimicrob. Agents Chemother., 2012, vol. 56, no. 12, pp. 6441-6441. doi: 10.1128/AAC.01001-07

38. Takano T., Hung W.C., Shibuya M., Higuchi W., Iwao Y., Nishiyama A., Reva I., Khokhlova O.E., Yabe S., Ozaki K., Takano M., Yamamoto T. A new local variant (ST764) of the globall y disseminated ST5 lineage of hospital-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) carrying the virulence determinants of community-associated MRSA. Antimicrob. Agents Chemother. 2013, vol. 57, pp. 1589-1595. doi: 10.1128/AAC.01147-12

39. Unal S., Garcia-Rodriguez J.A. Activity of meropenem and comparators against Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter spp. Isolated in the MYSTIC Program, 2002—2004. Diagn. Microbiol. Infect. Dis., 2005, vol. 53, no. 4, pp. 256—271. doi: 10.1016/j.diagmicrobio.2005.10.002

40. Warnes S.L., Highmore C.J., Keevil C.W. Horizontal transfer of antibiotic resistance genes on abiotic touch surfaces: implications for public health. mBio, 2012, vol. 3, no. 6, pp. 489—501. doi: 10.1128/mBio.00489-12

41. Wilson H., Torok M.E. Extended-spectrum-beta-lactamases-producing and carbapenem-producing Enterobacteriaceae. Microb. Genom., 2018, vol. 4, pp. 1—14. doi: 10.1099/mgen.0.000218

42. Zwaluw K. van der, Haan A. de, Pluister G.N., Bootsma H.J., Neeling A.J. de, Schouls L.M. The carbapenem inactivation method (CIM), a simple and low-cost alternative for the Carba NP test to assess phenotypic carbapenemase activity in gram-negative rods. PLoS One, 2015, vol. 10, no. 3: e0123690. doi: 10.1371/journal.pone.0123690


Дополнительные файлы

Для цитирования:


Хохлова О.Е., Ларионова И.А., Перьянова О.В., Козлов Р.С., Эйдельштейн М.В., Модестов А.А., Еремеева О.Г., Лазарева И.В., Акушева Д.Н., Лобова Т.И., Поткина Н.К., Сидоренко С.В., Ямамото Т. Механизмы антибиотикорезистентности основных возбудителей гнойно-воспалительных осложнений у онкологических больных. Инфекция и иммунитет. 2021;11(2):324-336. https://doi.org/10.15789/2220-7619-TMO-1379

For citation:


Khokhlova O.Е., Larionova I.A., Perianova O.V., Kozlov R.S., Eidelshtein M.V., Modestov A.A., Eremeeva O.G., Lazareva I.V., Akusheva D.N., Lobova T.I., Potkina N.K., Sidorenko S.V., Yamamoto T. The mechanisms of antibiotic resistance in major pathogens of purulent-inflammatory complications in cancer patients. Russian Journal of Infection and Immunity. 2021;11(2):324-336. (In Russ.) https://doi.org/10.15789/2220-7619-TMO-1379

Просмотров: 352


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2220-7619 (Print)
ISSN 2313-7398 (Online)