Preview

Инфекция и иммунитет

Расширенный поиск

Молекулярно-генетический анализ популяции Mycobacterium tuberculosis в Вологодской области — регионе с низкой заболеваемостью туберкулезом

https://doi.org/10.15789/2220-7619-MAG-1545

Полный текст:

Аннотация

Вологодская область характеризуется относительно спокойной эпидемической ситуацией по туберкулезу в России: показатель заболеваемости туберкулезом в 2010—2018 гг. снизился с 45,2 до 15,8 на 100 тыс. населения (44,4 в Российской Федерации). Однако доля больных туберкулезом с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ) возбудителя выросла с 12,1% в 2016 г. до 23,7% в 2018 г. Целью исследования была характеристика генетической структуры популяции M. tuberculosis и выявление основных генотипов, ассоциированных с первичной МЛУ возбудителя туберкулеза в Вологодской области. Изучено 82 штамма M. tuberculosis, выделенных в 2018 г. от вновь выявленных больных туберкулезом. Лекарственную чувствительность определяли стандартным методом абсолютных концентраций и с помощью BACTEC MGIT 960. Штаммы M. tuberculosis относили к генотипу Beijing и его основным подтипам, определяя специфические маркеры. Штаммы Beijing субтипировали методом MIRU-VNTR по стандартным 24 локусам, вычисляя индекс разнообразия Хантера— Гастона (HGDI). Штаммы группы non-Beijing сполиготипировали. К генотипу Beijing принадлежали 62,2% (51 из 82) штаммов. Среди штаммов Beijing наиболее многочисленным был кластер Central Asian/Russian (41,5%; 34 из 82 штаммов). Доли штаммов субтипа Central Asia Outbreak (CAO) и кластера B0/W148 составили 8,5% и 7,3% соответственно. Установлена принадлежность штаммов non-Beijing к семействам T (11%; 9 из 82), LAM (11%), Haarlem (6,1%) и Ural (4,9%). Среди 82 изолятов M. tuberculosis выявлено 33 (40,2%) МЛУ штамма, включая 27 принадлежащих к генотипу Beijing, в том числе, к кластерам Central Asian/Russian — 18 (66,7%), B0/W148 и CAO — по 4 (14,8%). MIRU-VNTR-типирование 51 штамма Beijing выявило 22 варианта профилей (HGDI = 0,852): самые многочисленные — 94-32 (35,3%) и 95-32 (15,7%) включали штаммы Central Asian/Russian и CAO; четыре штамма B0/W148 принадлежали к кластеру 100-32. Наиболее полиморфными были локусы QUB26 и MIRU26. Впервые проведенное в Вологодской области молекулярно-генетическое исследование выявило гетерогенность популяции M. tuberculosis, в которой доминировали штаммы генотипа Beijing. При этом доля известного в России и за ее пределами эпидемиологически и клинически значимого кластера Beijing B0/W148, ассоциированного с МЛУ, составила лишь 7,3%, что значительно меньше, чем в других регионах СЗФО РФ (~19%). Вместе с тем в структуре генотипов и среди МЛУ штаммов M. tuberculosis преобладали представители кластера Central Asian/Russian генотипа Beijing.

Об авторах

А. А. Вязовая
НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера
Россия

Вязовая Анна Александровна - кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии и эволюционной генетики.

197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14.

Тел.: 8 (812) 233-21-49



И. А. Лебедева
Вологодский областной противотуберкулезный диспансер
Россия

Заведующий клинико-диагностической лабораторией БУЗ ВО Вологодский областной противотуберкулезный диспансер.

Вологда.



Н. Б. Ушакова
Вологодский областной противотуберкулезный диспансер
Россия

Заместитель главного врача по медицинской части.

Вологда.



В. В. Павлов
Вологодский областной противотуберкулезный диспансер
Россия

Главный врач.

Вологда.



А. А. Герасимова
НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера
Россия

Младший научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии и эволюционной генетики.

Санкт-Петербург.



Н. С. Соловьева
НИИ фтизиопульмонологии Минздрава России
Россия

Кандидат медицинских наук, заведующий бактериологической лабораторией Санкт-Петербургского.

Санкт-Петербург.



В. Ю. Журавлев
НИИ фтизиопульмонологии Минздрава России
Россия

Кандидат медицинских наук, руководитель отдела лабораторной диагностики Санкт-Петербургского.

Санкт-Петербург.



О. В. Нарвская
НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера; НИИ фтизиопульмонологии Минздрава России
Россия

Доктор медицинских наук, профессор, ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии и эволюционной генетики НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера; научный консультант, Санкт-Петербургский НИИ фтизиопульмонологии Минздрава России.

Санкт-Петербург.



Список литературы

1. Военнопленные в СССР. 1936—1956. Том 6. Лагеря для военнопленных НКВД-МВД СССР (1939—1956) / под ред. М.М. Загорулько. Волгоград, 2013. 766с.

2. Вязовая А.А., Ахмедова Г.М., Соловьева Н.С., Герасимова А.А., Старкова Д.А., Туркин Е.Н., Журавлев В.Ю., Нарвская О.В., Мокроусов И.В. Молекулярная эпидемиология туберкулеза в Калининградской области России: 10 лет спустя // Инфекция и иммунитет. 2017. Т. 7, № 4. С. 367—374. doi: 10.15789/2220-7619-2017-4-367-374

3. Вязовая А.А., Соловьева Н.С., Сунчалина Т.В., Мокроусов И.В., Журавлев В.Ю., Нарвская О.В. Характеристика популяции Mycobacterium tuberculosis в Республике Карелия // Туберкулез и болезни легких. 2016. № 8. С. 48-53. doi: 10.21292/2075-1230-2016-94-8-48-53

4. Жданова С.Н., Огарков О.Б., Синьков В.В., Хромова П.А., Орлова Е.А., Кощеев М.Е., Савилов Е.Д. Эпидемиологическое обоснование распространения основных клонов генотипа Beijing Mycobacterium tuberculosis в Иркутской области // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2017. № 6. С. 88-94. doi: 10.36233/0372-9311-2017-6-88-94

5. Ресурсы и деятельность противотуберкулезных организаций Российской Федерации в 2017-2018 гг. (статистические материалы). М.: РИО ЦНИИОИЗ, 2019. 101 с.

6. Синьков В.В., Огарков О.Б., Савилов Е.Д. Реконструкция эпидемической истории «пекинского генотипа» Mycobacterium tuberculosis в России и странах бывшего СССР по результатам сполиготипирования // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2011. № 3. С. 25-29.

7. Умпелева Т.В., Кравченко М.А., Еремеева Н.И., Вязовая А.А., Нарвская О.В. Молекулярно-генетическая характеристика штаммов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих на территории Уральского региона России // Инфекция и иммунитет. 2013. Т. 3, № 1. C. 21—28. doi: 10.15789/2220-7619-2013-1-21-28

8. Merker M., Barbier M., Cox H., Rasigade J.P., Feuerriegel S., Kohl T.A., Diel R., Borrell S., Gagneux S., Nikolayevskyy V., Andres S., Nubel U., Supply P., Wirth T., Niemann S. Compensatory evolution drives multidrug-resistant tuberculosis in Central Asia. eLife, 2018, no. 7: e38200. doi: 10.7554/eLife.38200

9. Merker M., Blin C., Mona S., Duforet-Frebourg, N., Lecher S., Willery E., Blum M.G., Rusch-Gerdes S., Mokrousov I., Aleksic E., Allix-Beguec C., Antierens A., Augustynowicz-Kopec E., Ballif M., Barletta F., Beck H.P., Barry C.E. the 3rd, Bonnet M., Borroni E., Campos-Herrero I., Wirth T. Evolutionary history and global spread of the Mycobacterium tuberculosis Beijing lineage. Nature Genetics, 2015, vol. 47, no. 3, pp. 242—249. doi: 10.1038/ng.3195

10. Mokrousov I., Ly H.M., Otten T., Lan N.N., Vyshnevskyi B., Hoffner S., Narvskaya O. Origin and primary dispersal of the Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype: clues from human phylogeography. Genome Res., 2005, vol. 15, no. 10, pp. 1357— 1364. doi: 10.1101/gr.3840605

11. Narvskaya O., Mokrousov I., Otten T., Vishnevsky B. Molecular markers: application for studies of Mycobacterium tuberculosis population in Russia. In: Trends in DNA Fingerprinting Research. Ed. by M.M. Read. New York: Nova Science Publishers, 2005, pp. 111-125.

12. Shitikov E., Vyazovaya A., Malakhova M., Guliaev A., Bespyatykh J., Proshina E., Pasechnik O., Mokrousov I. Simple assay for detection of the Central Asia outbreak clade of the Mycobacterium tuberculosis Beijing Genotype. J. Clin. Microbiol., 2019, vol. 57, no. 7: e00215-19. doi: 10.1128/JCM.00215-19

13. Umpeleva T., Belousova K., Golubeva L., Boteva T., Morozova I., Vyazovaya A., Mokrousov I., Eremeeva N., Vakhrusheva D. Molecular characteristics of Mycobacterium tuberculosis in the “closed” Russian town with limited population migration. Infect. Genet. Evol., 2020, no. 79: 104174. doi: 10.1016/j.meegid.2020.104174

14. Vyazovaya A., Mokrousov I., Solovieva N., Mushkin A., Manicheva O., Vishnevsky B., Zhuravlev V., Narvskaya O. Tuberculous spondylitis in Russia and prominent role of multidrug-resistant clone Mycobacterium tuberculosis Beijing B0/W148. Antimicrob. Agents Chemother., 2015, vol. 59, no. 4, pp. 2349-2357. doi: 10.1128/AAC.04221-14

15. Vyazovaya A., Proshina E., Gerasimova A., Avadenii I., Solovieva N., Zhuravlev V., Narvskaya O., Mokrousov I. Increased transmissibility of Russian successful strain Beijing B0/W148 of Mycobacterium tuberculosis: Indirect clues from history and demographics. Tuberculosis (Edinb.), 2020, vol. 122: 101937. doi: 10.1016/j.tube.2020.101937


Дополнительные файлы

Для цитирования:


Вязовая А.А., Лебедева И.А., Ушакова Н.Б., Павлов В.В., Герасимова А.А., Соловьева Н.С., Журавлев В.Ю., Нарвская О.В. Молекулярно-генетический анализ популяции Mycobacterium tuberculosis в Вологодской области — регионе с низкой заболеваемостью туберкулезом. Инфекция и иммунитет. 2021;11(3):497-505. https://doi.org/10.15789/2220-7619-MAG-1545

For citation:


Vyazovaya А.A., Lebedeva I.A., Ushakova N.B., Pavlov V.V., Gerasimova A.A., Solovieva N.S., Zhuravlev V.Yu., Narvskaya O.V. Molecular and genetic analysis of Mycobacterium tuberculosis population in the Vologda Region with low tuberculosis incidence. Russian Journal of Infection and Immunity. 2021;11(3):497-505. (In Russ.) https://doi.org/10.15789/2220-7619-MAG-1545

Просмотров: 218


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2220-7619 (Print)
ISSN 2313-7398 (Online)