Preview

Инфекция и иммунитет

Расширенный поиск

Аcinetobacter baumannii bv Tryptophandestruens bv nov., выделенный из клинического материала

https://doi.org/10.15789/2220-7619-ABB-1676

Полный текст:

Аннотация

Цель исследования — определить таксономический статус группы атипичных штаммов Acinetobacter baumannii, выявить их характеристики и методы, необходимые для идентификации. Объектом исследования были 10 штаммов A. baumannii (из них 6 первичных), имеющих одинаковый профиль атипичных признаков. Они были выделены из клинического материала (моча, мокрота) в 2017–2019 гг. в Военно-медицинской академии. В сравнительных исследованиях использовали клинические штаммы типичных A. baumannii (n = 36), Acinetobacter nosocomialis (n = 14), Acinetobacter pittii (n = 9) и 1 штамм Acinetobacter calcoaceticus, выделенный из внешней среды. Атипичные штаммы обладали признаками бактерий комплекса A. calcoaceticus — A. baumannii (ACB) и были идентифицированы как A. baumannii. Утилизацию субстратов в качестве единственных источников углерода изучали на плотной синтетической среде с 0,2% субстрата при инкубации посевов 72 часа при 37°C. Окисление углеводов с кислотообразованием выявляли на среде Хью–Лейфсона и микрометодом. Биотрансформацию ароматических аминокислот осуществляли в жидких и плотных питательных средах по хромогенной реакции. Для генетической характеристики штаммов использовали ген rpoB. Амплификацию двух фрагментов гена rpoB длиной 940 п. н. и 1210 п. н. проводили методом стандартной полимеразной цепной реакции с использованием праймеров, имеющих описанные ранее последовательности. Продукты амплификации секвенировали по Сэнгеру с использованием BigDye Terminator v3.1 (Applied Biosystems, США) и капиллярного электрофореза на автоматическом секвенаторе ABI PRISM 3130 (Applied Biosystems, США) с последующим применением методов определения уровней сходства секвенированных фрагментов с последовательностями гена rpoB референс-штамма A. baumannii ATCC 17978 (GenBank acc. no. CP053098.1). Было установлено, что все штаммы группы атипичных A. baumannii имели специфическую совокупность признаков, отличающих их от типичных штаммов A. baumannii и других видов комплекса АСВ: наличие биотрансформации L-триптофана (антранилатным путем) и антраниловой кислоты при однозначном отсутствии этих признаков у других бактерий; отсутствие утилизации гиппурата натрия и L-арабинозы при однозначном наличии утилизации у других бактерий; отсутствие утилизации L-триптофана, путресцина, L-орнитина при наличии утилизации у большинства штаммов других видов. Генетический анализ показал, что контрольные штаммы типичных A. baumannii имели 99,20–99,21% сходства последовательностей секвенированных фрагментов гена rpoB с последовательностями гена rpoB референсного штамма. Такие же показатели имели все 10 штаммов атипичных A. baumannii (99,20–99,21%). При этом показатели контрольных штаммов других видов достоверно отличались: A. nosocomialis — 95,10–95,97%, A. pittii — 94,63–94,92%, A. calcoaceticus — 93,00%. Следовательно, штаммы атипичных и типичных A. baumannii генетически однородны и принадлежат к одному виду. Представленные факты позволяют считать данную группу атипичых штаммов A. baumannii новым биоваром. Предлагаем название новому биовару: tryptophandestruens (триптофанразрушающий) (лат. destruens — разрушаю щий). Идентификацию бактерий A. baumannii bv. tryptophandestruens можно осуществлять в лабораториях любого уровня тестами на биотрансформацию L-триптофана и утилизацию гиппурата натрия.

Об авторах

Е. П. Сиволодский
ФГБВОУ ВО Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова МО РФ; ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера
Россия

д.м.н., профессор кафедры микробиологии; старший научный сотрудник лаборатории молекулярно-биологических технологий  

Санкт-Петербург



Л. А. Краева
ФГБВОУ ВО Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова МО РФ; ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера
Россия

Краева Людмила Александровна,  д.м.н., зав. лабораторией медицинской бактериологии; профессор кафедры микробиологии 

197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14

Тел.: 8 (812) 232-94-85. Факс: 8 (812) 498-09-39



Д. А. Старкова
ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера
Россия

к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории идентификации патогенов, научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии и эволюционной генетики 

Санкт-Петербург



Н. В. Михайлов
ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера
Россия

к.м.н., старший научный сотрудник отдела новых технологий 

Санкт-Петербург



Г. В. Горелова
ФГБВОУ ВО Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова МО РФ
Россия

зав. лабораторией бактериологии Центральной клинико-диагностической лаборатории 

Санкт-Петербург



Список литературы

1. Сиволодский Е.П., Фрейлихман О.А. Генетическая и фенотипическая характеристика изолятов Klebsiella michiganensis // Инфекция и иммунитет. 2019. Т. 9, № 5–6. С. 648–654. [Sivolodskii T.P., Freylikhman O.A. Genetic and phenotypic characteristics of Klebsiella michiganensis. Infektsiya i immunitet = Russian Journal of Infection and Immunity, 2019, vol. 9, no. 5–6, pp. 648–654. (In Russ.)] doi: 10.15789/2220-7619-2019-5-6-648-654

2. Brandenburg K.S., Rodriguez K.J., McAnulty J.F., Murphy C.J., Abbott N.L., Schurr M.J., Czuprynski C. Tryptophan inhibits biofilm formation by Psedomonas aeruginosa. Antimicrob. Agents Chemother., 2013, vol. 57, no. 4, pp. 1921–1925. doi: 10.1128/AAC.00007-13

3. Cosgaya C., Mari-Almirall M., Van Assche A., Fernandez-Orhn D., Mosqueda N., Telli M., Huys G., Higginns P., Seifert H., Lievens B., Roce I., Vila J. Acinetobacter dijkshoorniae sp. nov., a member of tho Acinetobacter calcoaceticus — Acinetobacter baumannii complex mainly recovered from clinical samples in different countries. Int. J. Syst. Evoi. Microbiol., 2016, vol. 66, pp. 4105–4111. doi: 10.1099/ijsem.0.001318

4. Chakraborty P., Daware A.V., Kumari M., Chatterjee A., Bhattagharyya D., Mitra G., Akhter Y., Bhattacharjee S., Ttibedi P. Free tryptophan residues inhibit quorum sensing of Pseudomonas aeruginosa: a potential approach to ingibit the development of microbial biofilm. Arch. Microbiol., 2018, vol. 200, no. 10, pp. 1419–1425. doi: 10.1007/s00203-018-1557-4

5. Kurnasov O., Jablonsky L., Polanuyer B., Dorrestein P., Bergley T., Osterman A. Aerobic tryptophan degradation pathway in bacteria: novel kynurenine formamidase. FEMS Microbiol. Lett., 2003, vol. 227, no. 2, pp. 219–227. doi: 10.1016/s0378-1097(03)00684-0

6. Li X.H., Kim S.K., Lee J.H. Anti-biofilm effects of anthranilate on a range of bacteria. Sci. Rep., 2017, vol. 7, no. 1: 8604. doi: 10.1038/s41598-017-06540-1

7. Nemec A., Krisova I., Maixerova M., van der Reijden T.J.K., Deschaght P., Passet V., Vaneechoutte M., Brisse S., Dijkshoorn L. Genotypic and phenotypic characterization of the Acinetobacter calcoaceticus — Acinetobacter baumannii complex with the proposal of Acinetobacter pittii sp. nov. (formerly Acinetobacter genomic species 3) and Acinetobacter nosocomialis sp. nov. (formerly Acinetobacter genomic species 13 TU). Res. Microbiol., 2011, vol. 162, no. 2, pp. 393–404. doi: 10.1016/j.resmic.2011.02.006

8. Nemec A., Krisova I., Maixnerova M., Sedo O., Brisse S., Higgins P.G. Acinetobacter seifertii sp. nov., a membtr of Acinetobacter calcoaceticus — Acinetobacter baumannii complex isolated from human clinical specimens. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2015, vol. 65, pp. 934–942. doi: 10.1099/ijs.0.000043

9. Rooney A.P., Dunlap C.A., Flor-Weiler L.B. Acinetobacter lactucae sp. nov., isolated from iceberg lettuce (Asteraceae: Lactuca sativa). Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2016, vol. 66, no. 9, pp. 3566–3572. doi: 10.1099/ijsem.0.001234

10. Vijayakumar S., Biswas I., Veerarayhaven B. Accurate identification of clinically important Acinetobacter spp.: an update. Future Sci. OA, 2019, vol. 5, no. 6: FSO395. doi: 10.2144/fsoa-2018-0127

11. Wang J., Ruan Z., Feng Y., Fu Y., Jiang Y., Weng H., Yu Y. Species distribution of clinical Acinetobacter isolates revealed by different identification techniques. PLoS One, 2014, vol. 9, no. 8: e104882. doi: 01371/journal.pone.0104882


Дополнительные файлы

Для цитирования:


Сиволодский Е.П., Краева Л.А., Старкова Д.А., Михайлов Н.В., Горелова Г.В. Аcinetobacter baumannii bv Tryptophandestruens bv nov., выделенный из клинического материала. Инфекция и иммунитет. 2021;11(5):965-972. https://doi.org/10.15789/2220-7619-ABB-1676

For citation:


Sivolodskii E.P., Kraeva L.A., Starkova D.A., Mikhailov N.V., Gorelova G.V. Аcinetobacter baumannii bv Tryptophandestruens bv nov. isolated from clinical samples. Russian Journal of Infection and Immunity. 2021;11(5):965-972. (In Russ.) https://doi.org/10.15789/2220-7619-ABB-1676

Просмотров: 101


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2220-7619 (Print)
ISSN 2313-7398 (Online)