Preview

Инфекция и иммунитет

Расширенный поиск

СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ МЕТОДОВ ИДЕНТИФИКАЦИИ НЕТУБЕРКУЛЕЗНЫХ МИКОБАКТЕРИЙ, ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ КЛИНИЧЕСКОГО МАТЕРИАЛА

https://doi.org/10.15789/2220-7619-2017-3-285-291

Полный текст:

Аннотация

В последнее время наблюдается значительный рост заболеваемости микобактериозами, который обуслеовлен увеличением доли иммуносупрессированных пациентов, наличием у них различных коморбидных состояний, а также совершенствованием методов диагностики. Выбор наиболее точного метода идентификации является крайне важным в определении тактики лечения пациентов.

Цель исследования — провести сравнительный анализ современных методов идентификации  НТМБ,  выделенных из клинического материала в 2015 г. в Самарской области. В работе проводилась идентификация 78 штаммов микроорганизмов. Лабораторная диагностика проводилась с использованием метода ДНК-гибридизации  и методом MALDIToF масс-спектрометрии. 

Результаты. При идентификации  микроорганизмов с использованием MALDIToF масс-спектрометрии  было выделено 16 штаммов (20,5%) M. kansasii; по 11 штаммов (14,1%) M. avium и M. fortuitum; 9 штаммов (11,5%) M. gordonae; по 3 штамма (3,8%) M. peregrinum, M. szulgai, M. chimera intracellulare group, по 2 штамма (2,6%) M. abscessus, M. septicum, M. paragordonae, M. senegalence, по 1 штамму (1,3%) M. chelonae, M. frederiksbergense, M. monacense, M. lentiflavum. При использовании метода масс-спектрометрии было идентифицировано  15 видов НТМБ,  методом ДНК-гибридизации  — 9 видов. Полное  совпадение результатов идентификации было отмечено всего у 45 (57,7%) штаммов, несовпадающие результаты выявлены у 16 штаммов (20,5%). Наиболее часто при использовании метода ДНК-гибридизации  несовпадение было выявлено у медленнорастущих культур (9 штаммов) с преобладанием микроорганизмов,  идентифицированных  как M. gordonae. Среди представителей быстрорастущих НТМБ  было выявлено 7 расхождений в идентификации, более часто среди представителей групп M. fortuitum и M. peregrinum. Особое внимание стоит обратить на идентификацию штамма M. kansasii молекулярно-генетическим методом, который масс-спектрометрией был определен как M. bovis. Обе культуры M. tuberculosis complex, которые были идентифицированы при помощи MALDI-ToF  спектрометрии, ДНК-гибридизацией  не были определены до вида. 17 (21,8%) штаммов микроорганизмов,  которые не были идентифицированы  при использовании  метода ДНК-гибридизации, идентифицированы  с помощью спектрометрии, включая медленнорастущие микроорганизмы,  не относящиеся к микобактериям 7 штаммов (9,0%): Gordonia rubriperticta, Nocardia forcinica, Tsukumurella spp., Rhodotorula mucilaginosa. Точная видовая идентификация НТМБ является основополагающей для определения тактики лечения пациентов с микобактериозами. Возможности идентификации нетуберкулезных микобактерий с использованием метода ДНК-гибридизации являются недостаточными на сегодняшний день. Внедрение новых методов, таких как MALDI-ToF спектрометрия, позволяет идентифицировать большее количество видов нетуберкулезных микобактерий, а также другие виды медленнорастущих микроорганизмов, имеющих сходства с микобактериями по культуральным и морфологическим свойствам, что значительно повышает диагностические возможности лабораторий.

Об авторах

А. В. Лямин
Самарский государственный медицинский университет МЗ РФ
Россия

Лямин Артем Викторович кандидат медицинских наук, доцент кафедры общей и клинической микробиологии, иммунологии и аллергологии.

443079, Самара, ул. Гагарина, 18. Тел.: 8 (846) 260-33-61



Д. Д. Исматуллин
Самарский государственный медицинский университет МЗ РФ

Студент 6 курса медико-профилактического факультета



А. В. Жестков
Самарский государственный медицинский университет МЗ РФ

Доктор медицинских наук, профессор, зав. кафедрой общей и клинической микробиологии, иммунологии и аллергологии



А. М. Ковалев
Самарский областной клинический противотуберкулезный диспансер им. Н.В. Постникова

Кандидат биологических наук, биолог бактериологической лаборатории



Л. А. Барышникова
Самарский областной клинический противотуберкулезный диспансер им. Н.В. Постникова

Доктор медицинских наук, заместитель  главного врача по медицинской части



С. С. Неняйкин
Самарский государственный медицинский университет МЗ РФ

Заведующий отделением инфекционной безопасности и гигиены Клиник 



Список литературы

1. Бердников, Р.Б., Гринберг Л.М., Евсеев А.Ю. Летальный случай генерализованного микобактериоза у больного с терминальной стадией ВИЧ-инфекции // Туберкулез и болезни легких. 2016. Т. 94, № 4. С. 57–62. [Berdnikov R.B., Grinberg L.M., Evseev A.Yu. The lethal case of generalized mycobacteriosis in the patient at the terminal stage of HIV-infection. Tuberkulez i bolezni legkikh = Tuberculosis and Lung Disease, 2016, no. 4, pp. 47–62. doi: 10.21292/2075-1230-2016-94-4-57-64 (In Russ.)]

2. Майская, М.Ю., Оттен Т.Ф., Ариэль Б.М. Формы легочного и генерализованного микобактериоза при ВИЧ-инфекции в морфологическом освещении // Туберкулез и социально-значимые заболевания. 2014. № 1–2. С. 21–25. [Maiskaya M.Yu., Otten T.F., Ariel B.M. Pulmonary and generalized forms of mycobacteriosis in HIV infection in the morphological aspect. Tuberkulez i sotsial’no-znachimye zabolevaniya = Tuberculosis and Socially Significant Diseases, 2014, no. 1–2, pp. 21–25 (In Russ.)]

3. Михайловский, А.М., Чуркин С.А., Пашкова Н.А., Лепеха Л.Н. Первый случай посмертной диагностики генерализованного нетуберкулезного микобактериоза у больной на поздней стадии ВИЧ-инфекции в Оренбургской области // Вестник современной клинической медицины. 2016. Т. 9, № 5. С. 88–93. [Mihajlovskij A.M., Churkin S.A., Pashkova N.A., Lepeha L.N. The first case of post-mortem diagnosis of generalized non-tuberculosis mycobacteriosis in a patient with advanced HIV infection in the Orenburg region. Vestnik sovremennoi klinicheskoi meditsiny = Herald of Modern Clinical Medicine, 2016, no. 5, pp. 88–93. doi: 10.20969/VSKM.2016.9(5).88-93 (In Russ.)]

4. Оттен Т.Ф., Фоменкова Н.В., Майская М.Ю. Генерализованный микобактериоз у пациента с ВИЧ-инфекцией на стадии СПИДа // Туберкулез и болезни легких. 2015. № 8. С. 57–62. [Otten T.F., Fomenkova N.V., Majskaja M.Ju. Generalised mycobacteriosis in a patient with HIV infection with AIDS. Tuberkulez i bolezni legkikh = Tuberculosis and Lung Disease, 2015, no. 8, pp. 57–62 (In Russ.)]

5. Чучалин А.Г. Респираторная медицина. Москва: ГЭОТАР-Медиа, 2007. Т. 1. 800 c. [Chuchalin A.G. Respiratornaya meditsina [Respiratory medicine]. Moscow: GEOTAR-Media, 2007, vol. 1, 800 p.

6. Daley C.L., Griffith D.E. Pulmonary non-tuberculous mycobacterial infections. Int. J. Tuberc. Lung. Dis., 2010, vol. 14, no. 6, pp. 665–671. doi: 10.4046/trd.2014.77.1.1

7. Jorgensen J.H., Carroll K.C., Funke G., Landry M.L., Richter S.S., Warnock D.W. Manual of Clinical Microbiology, 11th ed., vol. 1, pp. 536–570. doi: 10.1128/9781555817381

8. Hall L., Doerr K.A., Wohlfiel S.L., Roberts G.D. Evaluation of the MicroSeq system for identification of mycobacteria by 16S ribosomal DNA sequencing and its integration into a routine clinical mycobacteriology laboratory. J. Clin. Microbiol., 2003. no. 41, pp. 1447–1453.

9. Lee A.S., Jelfs P., Sintchenko V., Gilbert G.L. Identification of non-tuberculous mycobacteria: utility of the GenoType Mycobacterium CM/AS assay compared with HPLC and 16S rRNA gene sequencing. J. Med Microbiol., 2009, no. 58, pp. 900 – 904. doi: 10.1099/jmm.0.007484-0

10. Springer B., Stockman L., Tescher K., Roberts G.D., Böttger E.C. Two-laboratory collaborative study on identification of mycobacteria: molecular versus phenotypic method. J. Clin. Microbiol., 1996, no. 34, pp. 296–303.

11. Tortoli E. Impact of genotypic studies on mycobacterial taxonomy: the new mycobacteria of the 1990’s. J. Clin. Microbiol. Rev., 2003, no. 2, pp. 319–354. doi: 10.1128/CMR.16.2.319-354.2003


Для цитирования:


Лямин А.В., Исматуллин Д.Д., Жестков А.В., Ковалев А.М., Барышникова Л.А., Неняйкин С.С. СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ МЕТОДОВ ИДЕНТИФИКАЦИИ НЕТУБЕРКУЛЕЗНЫХ МИКОБАКТЕРИЙ, ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ КЛИНИЧЕСКОГО МАТЕРИАЛА. Инфекция и иммунитет. 2017;7(3):285-291. https://doi.org/10.15789/2220-7619-2017-3-285-291

For citation:


Lyamin A.V., Ismatullin D.D., Zhestkov A.V., Kovalyov A.M., Baryshnikova L.A., Nenjajkin S.S. COMPARATIVE ANALYSIS OF METHODS FOR IDENTIFICATION OF NONTUBERCULOUS MYCOBACTERIA ISOLATED FROM CLINICAL MATERIAL. Russian Journal of Infection and Immunity. 2017;7(3):285-291. (In Russ.) https://doi.org/10.15789/2220-7619-2017-3-285-291

Просмотров: 308


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2220-7619 (Print)
ISSN 2313-7398 (Online)