Preview

Инфекция и иммунитет

Расширенный поиск

Общая характеристика и клиническое значение представителей родов Nocardia и Gordonia

https://doi.org/10.15789/2220-7619-2019-3-4-429-436

Полный текст:

Аннотация

В последнее время в современной медицинской микробиологии довольно большое внимание уделено изучению семейств Actinomycetaceae, Corynebacteriaceae, Mycobacteriaceae, Nocardiaceae, Gordoniaceae. Представители семейства Mycobacteriaceae все чаще становятся объектом научного и практического интереса, в то время как бактерии из таких семейств, как Nocardiaceae и Gordoniaceae остаются малоизученными, несмотря на то что в практической микробиологии появляются новые методы, позволяющие проводить более точную идентификацию микроорганизмов. По данным современной классификации, род Nocardia включает в себя свыше 80 видов, большинство из которых редко вызывают заболевания у людей. Наиболее часто представители рода Nocardia вызывают поражения бронхолегочной системы, однако возможно развитие патологических процессов других локализаций. Такая же ситуация складывается с инфекционными поражениями, обусловленными представителями рода Gordonia. Представители рода Gordonia ранее часто неправильно идентифицировались в качестве других актиномицет или микобактерий, но использование 16S рРНК секвенирования позволило значительно улучшить идентификацию этих микроорганизмов. В настоящее время число микроорганизмов, имеющих потенциальное клиническое значение среди аэробных актиномицет возрастает. Так же как и при нокардиозах, первичные и вторичные иммунодефициты различной этиологии играют первостепенную роль в развитии патологических процессов, связанных с гордониями. Однако дополнительным фактором риска может быть патологические состояния, связанные с попаданием в организм человека инородных тел, колонизированных данными микроорганизмами. Наиболее часто представители рода Nocardia вызывают поражения в бронхолегочной системе, однако возможно развитие патологии и других локализаций. Половина всех случаев легочного нокардиоза сопровождается патологическими процессами внелегочной локализации. Только около 20% пациентов имеют внелегочную форму заболевания, которая обычно возникает при распространении возбудителя гематогенно или другими путями, однако при них также характерно первичное легочное поражение. Такая же ситуация складывается с инфекционными поражениями, обусловленными представителями рода Gordonia. В настоящее время число микроорганизмов, имеющих потенциальное клиническое значение, среди аэробных актиномицет возрастает, в связи с этим все чаще в научной литературе поднимается вопрос об их роли в патологических процессах различной этиологии. Сообщений об инфекциях, связанных с бактериями из рода Gordonia, относительно мало, что возможно связано с тем, что большое количество микроорганизмов может быть не выделено из клинического материала или они могут быть ошибочно идентифицированы как микобактерии или нокардии. Так же как и при нокардиозах, иммунодефициты различной этиологии играют первостепенную роль в развитии патологических процессов, связанных с гордониями. Однако дополнительным фактором риска могут быть патологические состояния, связанные с попаданием в организм человека инородных тел, колонизированных данными микроорганизмами. В ряде публикаций описано этиологическое значение гордоний при развитии холицистита, гранулематозного поражения кожи, абсцесса века, других мягких тканей, гранулематозного мастита, абсцесса мозга и менингита, а также наружного отита, бронхита, эндокардита и медиастенита. Помимо этого, все эти микроорганизмы могут вызвать бактериемию, связанную с использованием центрального венозного катетера. И в связи с появлением новых методов идентификации, увеличением количества иммунокомпрометированных пациентов, и, как следствие, и выявлением новых случаев заболеваний, вызванных представителями семейств Nocardiaceae и Gordoniaceae, интерес к данным группам микроорганизмов будет только расти.

Об авторах

А. В. Лямин
ФГБОУ ВО Самарский государственный медицинский университет МЗ РФ
Россия

доцент кафедры общей и клинической микробиологии, иммунологии и аллергологии,

г. Самара



А. В. Жестков
ФГБОУ ВО Самарский государственный медицинский университет МЗ РФ
Россия

д.м.н., профессор, зав. кафедрой общей и клинической микробиологии, иммунологии и аллергологии,

г. Самара



Т. Р. Никитина
ФГБОУ ВО Самарский государственный медицинский университет МЗ РФ
Россия

к.м.н., доцент кафедры общей и клинической микробиологии, иммунологии и аллергологии,

г. Самара



В. С. Подсевалов
ФГБОУ ВО Самарский государственный медицинский университет МЗ РФ
Россия

студент лечебного факультета,

г. Самара



А. Р. Трофимов
ФГБОУ ВО Самарский государственный медицинский университет МЗ РФ
Россия

студент лечебного факультета,

г. Самара



Д. Д. Исматуллин
ФГБОУ ВО Самарский государственный медицинский университет МЗ РФ
Россия

ординатор кафедры фундаментальной и клинической биохимии с лабораторной диагностикой,

г. Самара



Список литературы

1. Определитель бактерий Берджи: в 2 т. Под ред. Дж. Хоулта, Н. Крига, П. Смита, Дж. Стейли, С. Уилльямса. М.: Мир, 1997. 800 с.

2. Actinomycetales — list of prokaryotic names with standing in nomenclature. Retrieved 2016-10-04

3. Aggarwal D., Garg K., Chander J., Saini V., Janmeja A.K. Pulmonary nocardiosis revisited: a case series. Lung India, 2015, vol. 32, no 2, pp. 165–168. doi: 10.4103/0970-2113.152638

4. Al Akhrass F., Hachem R., Mohamed J.A., Tarrand J., Kontoyiannis D.P., Chandra J., Ghannoum M., Haydoura S., Chaftari A.M., Raad I. Central venous catheter-associated Nocardia bacteremia in cancer patients. Emerg. Infect. Dis., 2011, vol. 17, no. 9, pp. 1651–1658. doi: 10.3201/eid1709.101810

5. Arenskötter M., Bröker D., Steinbüchel A. Biology of the metabolically diverse genus Gordonia. Appl. Environ. Microbiol., 2004, vol. 70, no. 6, pp. 3195–3204. doi: 10.1128/AEM.70.6.3195-3204.2004

6. Beaman B.L. Interaction of Nocardia asteroides at different phases of growth with in vitro-maintained macrophages obtained from lungs of normal and immunized rabbits. Infect. Immun., 1979, vol. 26, pp. 355–361.

7. Bergey’s Manual of determinative bacteriology; 9th ed. Ed. J.G. Holt. Baltimore, Williams & Wilkins, 1994.

8. Blanc V., Dalle M., Markarian A., Debunne M.V., Duplay E., Rodriguez-Nava V., Boiron P. Gordonia terrae: a difficult-todiagnose emerging pathogen? J. Clin. Microbiol., 2007, vol. 45, no. 3, pp. 1076–1077. doi: 10.1128/JCM.02394-06

9. Blaschke A.J., Bender J., Byington C.L., Korgenski K., Daly J., Petti C.A, Pavia A.T., Ampofo K. Gordonia species: emerging pathogens in pediatric patients that are identified by 16S ribosomal RNA gene sequencing. Clin. Infect. Dis., 2007, vol. 45, pp. 483–486. doi: 10.1086/520018

10. Bridson E. The oxoid vade-mecum of microbiology. UK, Unipath Ltd., Basingstoke, 1993. 219 p.

11. Brown-Elliott B.A., Brown J.M., Conville P.S., Wallace R.J. Clinical and laboratory features of the Nocardia spp. based on current molecular taxonomy. Clin. Microbiol. Rev., 2006, vol. 19, no. 2, pp. 259–282. doi: 10.1128/CMR.19.2.259-282.2006I

12. Brown J.M., McNeil M.M. Nocardia, Rhodococcus, Gordonia, Actinomadura, Streptomyces, and other aerobic actinomycetes. In: Manual of clinical microbiology, 8th ed. Eds. P.R. Murray, E.J. Baron, M.A. Pfaller, F.C. Tenover, R.H. Yolken. Washington, D.C.: American Society for Microbiology, 2003, pp. 502–531.

13. Conville P.S., Brown-Elliott B.A., Smith T., Zelazny A.M. The complexities of nocardia taxonomy and identification. J. Clin. Microbiol., 2017, vol. 56, no. 1, pp. 1417–1419. doi: 10.1128/JCM.01419-17

14. Cummins C.S. Chemical composition and antigenic structure of cell walls of Corynebacterium, Mycobacterium, Nocardia, Actinomyces and Arthrobacter. J. Gen. Microbiol., 1962, vol. 28, pp. 35–50. doi: 10.1099/00221287-28-1-35

15. Davis-Scibienski C., Beaman B.L. Interaction of Nocardia asteroides with rabbit alveolar macrophages: association of virulence, viability, ultrastructural damage and phagosome-lysosome fusion. Infect. Immun., 1980, vol. 28, pp. 610–661.

16. DeCroos F.C., Garg P., Reddy A.K., Sharma A., Krishnaianh S., Mungale M., Mruthyunjaya P. Optimizing diagnosis and management of Nocardia keratitis, scleritis, and endophtalmatis: 11-year microbial and clinical overview. Ophthalmology, 2011, vol. 118, pp. 1193–1200. doi: 10.1016/j.ophtha.2010.10.037

17. Fang B.Z., Han M.X., Zhang L.Y., Jiao J.Y., Zhang X.T., Zhang Z.T., Wang Y., Nie G.X., Li W.J. Nocardia aurea sp. nov., a novel actinobacterium isolated from a karstic subterranean environment. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2018, vol. 69, no. 1, pp. 159–164. doi: 10.1099/ijsem.0.003122

18. Fang W., Li J., Cui H.S., Jin X., Zhai J., Dai Y., Li Y. First identification of Gordonia sputi in a post-traumatic endophthalmitis patient — a case report and literatures review. BMC Ophthalmol., 2017, vol. 17, no. 1: 190. doi: 10.1186/s12886-017-0573-5

19. Filice G.A., Beaman B.L., Krick J.A., Remington J.S. Effect of human neutrophils and monocytes on Nocardia asteroides: failure of killing despite occurrence of the oxidative metabolic burst. J. Infect. Dis., 1980, vol. 142, pp. 432–438.

20. Gao B., Gupta R. Phylogenetic framework and molecular signatures for the main clades of the phylum Actinobacteria. Microbiol. Mol. Biol. Rev., 2012, vol. 76, pp. 66–112. doi: 10.1128/MMBR.05011-11

21. Gil-Sande E., Brun-Otero M., Campo-Cerecedo F., Esteban E., Aguilar L., García-de-Lomas J. Etiological misidentification by routine biochemical tests of bacteremia caused by Gordonia terrae infection in the course of an episode of acute cholecystitis. J. Clin. Microbiol., 2006, vol. 44, no. 7, pp. 2645–2647. doi: 10.1128/JCM.00444-06

22. Goodfellow M. Numerical taxonomy of some nocardioform bacteria. J. Gen. Microbiol., 1971, vol. 69, no. 1, pp. 33–80. doi: 10.1099/00221287-69-1-33

23. Goodfellow M. Phylum XXVI. Actinobacteria phyl. nov. In: Bergey’s manual of systematic bacteriology; 2nd ed. Eds. M. Goodfellow, P. Kämpfer, H.-J. Busse, M.E. Trujillo, K.-I. Suzuki, W. Ludwig, W.B. Whitman. New York: Springer, 2012, pp. 33–2083.

24. Goodfellow M., Alderson G. The actinomycete-genus Rhodococcus: a home for the “rhodochrous” complex. J. Gen. Microbiol., 1977, vol. 100, no. 1, pp. 99–122. doi: 10.1099/00221287-100-1-99

25. Goodfellow M., Maldonado L.A. Genus Nocardia Trevisan 1889. In: Bergey’s manual of systematic bacteriology. New York: Springer, 2012, pp. 376–419.

26. Goodfellow M., Pirouz T. Numerical classification of sporoactinomycetes containing meso-diaminopimelic acid in the cell wall. J. Gen. Microbiol., 1982, vol. 128, no. 3, pp. 503–527. doi: 10.1099/00221287-128-3-503

27. Iida S., Taniguchi H., Kageyama A., Yazawa K., Chibana H., Murata S., Nomura F., Kroppenstedt R.M., Mikami Y. Gordonia otitidis sp. nov., isolated from a patient with external otitis. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, vol. 55, no. 5, pp. 1871–1876. doi: 10.1099/ijs.0.63282-0

28. Jannat-Khah D.P., Halsey E.S., Lasker B.A., Steigerwalt A.G., Hinrikson H.P., Brown J.M. Gordonia araii infection associated with an orthopedic device and review of the literature on medical device-associated Gordonia infections. J. Clin. Microbiol., 2009, vol. 47, no. 2, pp. 499–502. doi: 10.1128/JCM.01504-08

29. Johnson J.A., Onderdonk A.B., Cosimi L.A., Yawetz S., Lasker B.A., Bolcen S.J., Marty F.M. Gordonia bronchialis Bacteremia and pleural Infection: case report and review of the literature. J. Clin. Microbiol., 2011, vol. 49, no. 4, pp. 1662–1666. doi: 10.1128/JCM.02121-10

30. Kirmani N., Tuazon C.U., Ocuin J.A., Thompson A.M., Kramer N.C., Geelhoed G.W. Extensive cerebral nocardiosis cured with antibiotic therapy alone. Case report. J. Neurosurg., 1978, vol. 49, no. 6, pp. 924–928. doi: 10.3171/jns.1978.49.6.0924

31. Lesens O., Hansmann Y., Riegel P., Heller R., Benaissa-Djellouli M., Martinot M., Petit H., Christmann D. Bacteremia and endocarditis caused by a Gordonia species in a patient with a central venous catheter. Emerg. Infect. Dis., 2000, vol. 6, no. 4, pp. 382–385. doi: 10.3201/eid0604.000410

32. Linos A., Berekaa M.M., Steinbüchel A., Kim K.K., Sproer C., Kroppenstedt R.M. Gordonia westfalica sp. nov., a novel rubberdegrading actinomycete. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2002, vol. 52, no. 4, pp. 1133–1139. doi: 10.1099/00207713-52-4-1133

33. Long P.F. A retrospective study of Nocardia infections associated with the acquired immune deficiency syndrome (AIDS). Infection, 1994, vol. 2, pp. 362–364. doi: 10.1007/bf01715551

34. Ludwig W., Euzéby J., Schumann P., Buss H.J., Trujillo M.E., Kämpfer P., Whiteman W.B. Road map of the phylum Actinobacteria. In: Bergey’s manual of systematic bacteriology, 2012, vol. 5, pp. 1–28. doi: 10.1007/978-0-387-68233-4

35. Manual of clinical microbiology. Eds: Murray P.R., Baron E.J., Jorgensen J.H., Pfaller M.A., Yolken R.H. Washington, DC: ASM Press, 2003. 2310 p.

36. Maraki S., Chochlidakis S., Nioti E., Tselentis Y. Primary lymphocutaneous nocardiosis in an immunocompetent patient. Ann. Clin. Microbiol. Antimicrob. 2004, vol. 3: 24. doi: 10.1186/1476-0711-3-24

37. Marín M., Ruiz A., Iglesias C., Quiroga L., Cercenado E., Martín-Rabadán P., Bouza E, Rodríguez-Sánchez B. Identification of Nocardia species from clinical isolates using MALDI-Tof mass spectrometry. Clin. Microbiol. Infect., 2018, vol. 24 (12), pp. 1342. e5–1342.e8. doi: 10.1016/j.cmi.2018.06.014

38. McNeil M.M., Brown J.M. The medically important aerobic actinomycetes: epidemiology and microbiology. Clin. Microbiol. Rev., 1994, vol. 7, no. 3, pp. 357–417.

39. Saubolle M.A., Sussland D. Nocardiosis review of clinical and laboratory experience. J. Clin. Microbiol., 2003, vol. 41, no. 10, pp. 4497–4501. doi: 10.1128/JCM.01419-17

40. Simner P.J., Doerr K.A., Steinmetz L.K., Wengenack N.L. Mycobacterium and aerobic actinomycete culture: are two medium types and extended incubation times necessary? J. Clin. Microbiol., 2016, vol. 54, no. 4, pp. 1089–1093. doi: 10.1128/JCM.02838-15

41. Smego R.A. Jr, Moeller M.B., Gallis H.A. Trimethoprim-sulfamethoxazole therapy for Nocardia infections. Arch. Intern. Med., 1983, vol. 143, no. 4, pp. 711–718.

42. Sng L.H., Koh T.H., Toney S.R., Floyd M., Butler W.R., Tan B.H. Bacteremia caused by Gordonia bronchialis in a patient with sequestrated lung. J. Clin. Microbiol., 2004, vol. 42, no. 6, pp. 2870–2871. doi: 10.1128/JCM.42.6.2870-2871.2004

43. Stackebrandt E., Smida J., Collins M.D. Evidence of phylogenetic heterogeneity within the genus Rhodococcus: revival of the genus Gordonia (Tsukamura). J. Gen. Appl. Microbiol., 1988, vol. 34, pp. 341–348. doi: 10.2323/jgam.34.341

44. Staneck J.L., Roberts G.D. Simplified approach to identification of aerobic actinomycetes by thin-layer chromatography. Appl. Microbiol., 1974, vol. 28, no. 2, pp. 226–231.

45. Steinbrink J., Leavens J., Kauffman C.A., Miceli M.H. Manifestations and outcomes of nocardia infections: Comparison of immunocompromised and nonimmunocompromised adult patients. Medicine, 2018, vol. 97, no. 40: e12436. doi: 10.1097/MD.0000000000012436

46. Tsukamura M. Proposal of a new genus, Gordona, for slightly acid-fast organisms occurring in sputa of patients with pulmonary disease and in soil. J. Gen. Microbiol., 1971, vol. 68, no. 1, pp. 15–26. doi: 10.1099/00221287-68-1-15

47. Verma P., Brown J.M., Nunez V.H., Morey R.E., Steigerwalt A.G., Pellegrini G.J., Kessler H.A. Native valve endocarditis due to Gordonia polyisoprenivorans: case report and review of literature of bloodstream infections caused by Gordonia species. J. Clin. Microbiol., 2006, vol. 44, no. 5, pp. 1905–1908. doi: 10.1128/JCM.44.5.1905-1908.2006

48. Werno A.M., Anderson T.P., Chambers S.T., Laird H.M., Murdoch D.R. Recurrent breast abscess caused by Gordonia bronchialis in an immunocompetent patient. J. Clin. Microbiol., 2005, vol. 43, no. 6, pp. 3009–3010. doi: 10.1128/JCM.43.6.3009-3010.2005

49. Willis M.S., Cavuoti D., Gander R. Nocardia meningitis. Lab. Med., 2001, vol. 32, no. 11, pp. 695–699.

50. Wilson J.W. Nocardiosis: updates and clinical overview. Mayo. Clin. Proc., 2012, vol. 87, no. 4, pp. 403–407. doi: 10.1016/j.mayocp.2011.11.016

51. Woods G.L. Susceptibility testing for mycobacteria. Clin. Infect. Dis., 2000, vol. 31, no. 5, pp. 1209–1215. doi: 10.1086/317441

52. Yamamoto F., Yamashita S., Kawano H., Tanigawa T., Mihara Y., Gonoi T., Ando Y. Meningitis and ventriculitis due to Nocardia araoensis Infection. Intern. Med., 2017, vol. 56, no. 7, pp. 853–859. doi: 10.2169/internalmedicine.56.7332

53. Yasuike M., Nishiki I., Iwasaki Y., Nakamura Y., Fujiwara A., Shimahara Y., Kamaishi T., Yoshida T., Nagai S., Kobayashi T., Katoh M. Analysis of the complete genome sequence of Nocardia seriolae UTF1, the causative agent of fish nocardiosis: The first reference genome sequence of the fish pathogenic Nocardia species. PLoS One, 2017, vol. 1, no. 3: e0173198. doi: 10.1371/journal. pone.0173198

54. Zhi X.Y., Li W.J., Stackebrandt E. An update of the structure and 16S rRNA gene sequence-based definition of higher ranks of the class Actinobacteria, with the proposal of two new suborders and four new families and emended descriptions of the existing higher taxa. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2009, vol. 59, pp. 589–608. doi: 10.1099/ijs.0.65780-0


Дополнительные файлы

1. Метаданные
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Скачать (14KB)    
Метаданные
2. Титульный лист
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Скачать (14KB)    
Метаданные
3. Резюме
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Скачать (16KB)    
Метаданные
4. Подписи авторов
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Метаданные
5. Рекомендательное письмо А.А. Тотоляну
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Скачать (126KB)    
Метаданные
6. Литература
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Скачать (35KB)    
Метаданные

Для цитирования:


Лямин А.В., Жестков А.В., Никитина Т.Р., Подсевалов В.С., Трофимов А.Р., Исматуллин Д.Д. Общая характеристика и клиническое значение представителей родов Nocardia и Gordonia. Инфекция и иммунитет. 2019;9(3-4):429-436. https://doi.org/10.15789/2220-7619-2019-3-4-429-436

For citation:


Lyamin A.V., Zhestkov A.V., Nikitina T.R., Podsevalov V.S., Trofimov A.R., Ismatullin D.D. General characteristics and clinical significance of Nocardia and Gordonia genera. Russian Journal of Infection and Immunity. 2019;9(3-4):429-436. (In Russ.) https://doi.org/10.15789/2220-7619-2019-3-4-429-436

Просмотров: 78


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2220-7619 (Print)
ISSN 2313-7398 (Online)